Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  349  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101571700--101571757
25
2.3
25
87
0
80
0
53
1
44
1.10
101571697--101571790
25
3.6
25
76
16
77
1
46
2
50
1.20
101573482--101573528
17
2.8
17
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6
60
10
8
4
76
1.13
101573482--101573534
23
2.3
23
83
0
61
11
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3
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100
0
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22
0
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44
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100
0
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0
0
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0.95
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130
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26
18
20
35
1.95
101595250--101595297
21
2.2
22
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3
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60
2
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19
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2.0
29
82
6
71
63
1
3
31
1.22
101595717--101595869
23
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20
78
61
5
2
30
1.31
101595751--101595811
22
2.8
22
82
7
70
60
6
1
31
1.32
101595768--101595850
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2.5
32
83
11
105
60
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2
28
1.39
101595822--101595867
19
2.5
19
89
3
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63
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2
30
1.26
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3
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80
8
181
63
0
3
31
1.16
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14
193
28
22
18
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1.97
101601959--101602125
45
3.5
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17
153
28
23
17
31
1.97
101601852--101602171
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3.4
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79
7
306
28
23
17
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1.97
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4.3
143
87
0
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21
19
31
1.98
101611605--101611815
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3.2
64
62
20
151
29
26
18
26
1.98
101611571--101611856
137
2.1
136
97
0
536
31
25
18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101613642--101613800
26
6.2
25
91
3
239
35
23
5
34
1.79
101613642--101613800
51
3.1
51
91
3
241
35
23
5
34
1.79
101614985--101615151
83
2.0
81
96
2
307
50
5
20
23
1.68
101615323--101615374
25
2.0
26
85
10
72
51
0
0
48
1.00
101615517--101615588
16
4.6
16
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1
83
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22
5
44
1.75
101617045--101617093
24
2.0
26
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8
75
14
12
12
61
1.58
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12
12.8
12
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186
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0
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31
1.29
101618199--101618351
3
52.0
3
77
3
159
60
0
7
32
1.29
101619047--101619095
19
2.6
18
81
9
62
79
0
8
12
0.93
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24
2.0
24
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12
69
80
0
6
13
0.89
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17
2.1
17
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0
52
62
2
0
34
1.10
101619798--101619849
23
2.3
23
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6
79
40
0
1
57
1.10
101621787--101621822
18
2.0
18
94
0
63
33
19
16
30
1.94
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3
21.0
3
100
0
126
66
0
0
33
0.92
101622982--101623034
26
2.0
26
82
13
65
62
1
11
24
1.39
101623120--101623207
12
7.7
12
76
14
60
61
4
7
26
1.43
101623163--101623207
3
15.0
3
86
9
65
64
0
4
31
1.13
101624813--101625060
135
1.8
135
89
1
390
31
20
16
30
1.95
101624974--101625292
51
6.6
50
78
11
239
31
22
15
30
1.95
101625122--101625382
45
5.8
46
77
5
250
27
23
17
31
1.97
101625122--101625336
89
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83
2
245
28
24
16
31
1.96
101624974--101625384
134
2.9
136
81
6
403
29
22
16
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101625774--101625817
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1.9
23
100
0
88
27
20
15
36
1.93
101625924--101625961
19
2.0
19
100
0
76
52
10
10
26
1.68
101633496--101633540
19
2.3
20
88
7
67
44
6
22
26
1.77
101637504--101637539
18
2.0
18
94
0
63
63
0
8
27
1.23
101637505--101637544
21
1.9
21
89
0
62
62
0
10
27
1.27
101637572--101637653
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2.2
38
100
0
164
65
2
7
24
1.30
101637572--101637632
18
3.3
18
70
17
61
65
1
6
26
1.26
101637588--101637652
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3.3
20
71
16
73
69
3
7
20
1.27
101645678--101645714
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3
100
0
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0
0
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2
52
1.14
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100
0
100
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0
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2.00
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2.2
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24
15
21
38
1.92
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0
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51
2
0
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0
0
50
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0
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26
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54
1.64
101666878--101666916
2
20.0
2
84
5
53
51
5
0
43
1.24
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2
23.5
2
100
0
94
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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18
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2.0
26
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26
11
20
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1.77
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1.91
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2
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0
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0
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28
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0
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0
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0
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0
0
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0
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2.0
240
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22
0
31
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
30
1.56
101723548--101723699
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0
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0
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0
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0
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2.0
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100
0
386
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26
18
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101799266--101799299
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0
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2.2
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3
139
40
1
4
54
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427