Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  351  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102145542--102145572
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2.1
15
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0
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6
0
70
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2.2
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30
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1.75
102147718--102148095
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114
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2
643
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4.2
126
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0
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2.0
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0
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0
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1.47
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2.1
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0
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2.0
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2.0
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2
2
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2.0
22
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0
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5
40
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2
0
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1.11
102181462--102181495
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2.0
17
88
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2
0
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1.11
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1.9
142
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1
476
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2.0
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0
86
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16
1.9
16
93
0
53
61
12
3
22
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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32
2.8
32
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126
2
32
0
64
1.06
102187254--102187358
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5
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1
61
1.30
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70
11.3
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75
7
429
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22
15
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1.95
102194633--102195213
209
2.8
209
80
4
602
34
23
16
26
1.95
102194633--102195296
70
9.5
71
77
5
474
33
23
15
26
1.95
102195249--102195426
71
2.5
74
78
7
195
34
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17
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2.0
38
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1.96
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28
2.5
28
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18
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133
30
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1.94
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0
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1.21
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3
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3
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2
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87
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33
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3
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1.55
102254869--102254922
27
2.0
27
82
3
65
38
5
1
53
1.35
102257924--102257961
21
1.9
19
85
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60
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0
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1.33
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2.0
44
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25
18
25
30
1.98
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14.3
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72
17
65
47
13
19
19
1.82
102264200--102264266
25
2.7
25
90
0
107
46
13
20
19
1.83
102264386--102264444
26
2.3
26
91
2
93
42
18
23
15
1.88
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26
2.7
26
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6
79
40
18
24
15
1.90
102264595--102264659
22
3.0
22
80
8
78
30
21
26
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102265087--102265598
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19.0
27
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1
650
25
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17
37
1.94
102265654--102266195
27
20.3
27
84
6
622
31
10
18
39
1.84
102265654--102266195
268
2.0
267
94
0
958
31
10
18
39
1.84
102265590--102266195
54
11.3
53
80
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596
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19
38
1.85
102271295--102271331
19
1.9
19
89
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58
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10
10
1.14
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20
2.2
19
83
8
50
80
2
7
9
0.97
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0
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53
53
17
2
25
1.56
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2
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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60
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
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27
17
27
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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