Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  403  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116968725--116968784
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2.0
30
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0
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1
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0
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19
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3
3
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3.5
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261
20
22
16
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20
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1.46
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2.6
27
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43
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1.10
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42
0
1
55
1.10
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3.4
39
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28
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29
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2.6
23
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17
72
32
3
1
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2
43
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0
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6
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19
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0
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3.6
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2
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28
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6
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1.83
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0
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28
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2.0
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0
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23
2.0
23
95
0
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21
19
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0
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0
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135
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29
21
21
26
1.99
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21
2.5
21
100
0
106
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26
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374
38
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17
31
1.87
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14
2.2
14
94
0
53
67
0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117141015--117141051
19
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18
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67
0
0
32
0.91
117141036--117141133
30
3.4
27
69
24
67
62
5
5
27
1.38
117141029--117141157
57
2.2
59
78
12
142
63
5
4
26
1.36
117141435--117141470
18
2.0
18
94
0
63
22
0
52
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117141447--117141553
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3.4
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73
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90
17
0
49
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1.9
37
97
0
133
18
0
52
29
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1.99
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656
22
23
22
31
1.98
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172
3.3
171
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20
25
23
30
1.99
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20
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3.5
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21
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1.8
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23
21
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1.99
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132
3.9
132
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523
25
22
21
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1.99
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1.00
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0
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10
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0
23
0
76
0.78
117147197--117147241
21
2.1
21
91
0
72
15
24
22
37
1.93
117150732--117150975
126
1.9
126
95
0
443
37
15
18
29
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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0
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24
14
37
1.92
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11
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11
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5
51
0
27
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10
1.28
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1.9
24
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8
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6
0
29
1.18
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21
4.1
21
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0
22
1.10
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2.1
15
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71
0
0
28
0.86
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2.3
30
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19
5
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1.72
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4
25
1.37
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2.2
18
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1.91
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20
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0
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20
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2.0
135
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46
1.80
117181771--117181800
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0
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1.83
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0
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0
0
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0
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0
0
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0.93
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0
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0.59
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9
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1
1
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1.17
117193368--117193423
28
2.1
28
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1
0
50
1.11
117193371--117193446
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3
0
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117198196--117198240
21
2.1
22
83
4
56
26
6
0
66
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117202983--117203034
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2.5
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5
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27
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1
0
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2.0
20
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0
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1.8
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28
21
21
1.98
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28
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1.98
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2.0
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0
26
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1.80
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0
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0
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4.3
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7
92
33
21
26
18
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117242259--117242387
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29
1.98
117245008--117245200
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1.9
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233
29
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15
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1.95
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0
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0
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0
0
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0
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1.79
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0
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1.97
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0
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1.98
117288688--117288795
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3.5
31
88
5
164
30
18
25
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427