Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  6  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1778083--1778120
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0
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0
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0
80
15
10
0
75
1.05
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2.5
19
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29
29
20
20
1.98
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3.1
44
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141
29
28
20
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1.98
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30
2.0
30
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28
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2.4
24
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2.0
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22
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2.0
28
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2.3
30
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7
84
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1
4
59
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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17
26
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3.0
78
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0
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28
1.73
1876213--1876277
21
3.2
21
70
12
73
38
21
26
13
1.91
1876210--1876295
39
2.2
39
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0
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23
25
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13
2.2
13
100
0
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13
6
41
1.72
1879937--1879983
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19
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60
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4
0
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35
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0
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1911004--1911066
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52
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1
53
1.10
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2.0
30
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34
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1.24
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3.4
39
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20
27
28
1.99
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2.7
21
80
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25
100
0
100
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0
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50
60
0
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34
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1923993--1924040
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3.5
15
72
21
50
37
2
2
58
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1923980--1924043
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2.5
26
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23
2.0
23
100
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26
13
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27
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24
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1931693--1931884
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23
28
23
24
2.00
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2.3
81
83
7
227
23
27
24
24
2.00
1939712--1939903
40
4.8
39
76
8
163
23
28
23
24
2.00
1942861--1942910
25
2.0
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4
93
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10
18
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14
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29
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0
196
20
17
28
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1998773--1998931
52
3.0
52
83
0
201
27
15
27
30
1.96
2000650--2000706
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15
35
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16
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0
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0
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0
0
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20
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4
0
51
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0
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36
100
0
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5
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44
1.67
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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187
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1.9
230
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15
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4
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71
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2118552--2118613
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1.81
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165
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19
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0
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20
17
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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