Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  109  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28720217--28720295
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2.9
27
90
3
115
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20
26
21
1.98
28721101--28721275
26
6.8
26
87
0
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26
22
22
27
1.99
28721101--28721275
52
3.4
51
92
4
291
26
22
22
27
1.99
28721494--28721602
31
3.5
31
89
0
164
27
17
25
29
1.97
28727691--28727744
27
2.0
27
85
0
72
38
14
5
40
1.70
28732154--28732201
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6
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0
0
31
0.90
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58
68
0
0
31
0.90
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3.3
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1.70
28735024--28735053
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13
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10
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1.9
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20
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0
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0
0
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0
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2
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0.95
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2.3
60
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1
193
18
9
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32
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55
2.3
55
86
0
186
24
28
24
23
1.99
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22
2.0
22
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20
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155
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19
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29
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28760860--28760985
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2.7
46
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13
152
21
20
29
28
1.98
28770697--28770754
29
2.0
30
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3
82
37
0
41
20
1.53
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22
2.5
22
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3
92
46
11
9
33
1.71
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21
2.0
21
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4
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63
0
0
36
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16
2.6
16
85
3
59
16
6
13
62
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28772685--28772738
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3.4
16
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7
58
16
9
14
59
1.60
28787101--28787137
16
2.2
17
86
13
51
35
0
2
62
1.10
28788578--28788618
20
2.0
20
95
0
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48
2
4
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1.37
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24
2.1
25
96
3
97
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3
3
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30
2.2
30
94
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4
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4.6
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192
33
23
10
31
1.89
28802188--28802359
75
2.4
73
83
8
217
33
23
11
31
1.90
28805078--28805120
19
2.3
19
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2.4
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21
3.0
21
69
0
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26
17
1.91
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22
2.0
22
86
0
61
56
2
0
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26
4.2
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93
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25
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2.0
13
100
0
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15
30
38
15
1.88
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29
3.5
29
90
0
150
23
33
15
27
1.95
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29
3.5
29
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0
150
23
33
15
27
1.95
28847015--28847132
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3.1
41
60
28
98
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28
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71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
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1.94
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16
2.1
16
94
0
57
27
18
21
33
1.96
28859175--28859228
23
2.6
19
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13
63
38
14
7
38
1.75
28861570--28861600
15
2.0
15
93
6
53
25
3
0
70
1.02
28865132--28865166
16
2.2
16
89
0
52
20
5
17
57
1.60
28867908--28868082
39
4.5
40
84
5
157
26
29
22
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28867937--28868100
78
2.1
78
83
5
199
26
29
22
21
1.99
28867975--28868100
39
3.2
39
94
0
207
26
29
21
22
1.99
28873714--28874010
148
2.0
150
86
3
413
40
12
17
29
1.87
28881015--28881047
12
2.8
12
100
0
66
18
15
33
33
1.92
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18
2.1
18
95
0
67
42
42
2
13
1.57
28881311--28881349
20
2.0
20
84
0
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5
0
20
1.01
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9
86
0
73
27
11
20
40
1.87
28881369--28881427
18
3.3
18
82
0
82
27
11
20
40
1.87
28883534--28883584
25
2.0
25
96
0
93
49
17
7
25
1.74
28886175--28886227
25
2.1
25
100
0
106
16
7
35
39
1.78
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35
100
0
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24
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2.0
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21
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18
15
32
1.93
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2.4
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1.60
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2.0
25
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28927790--28927817
2
14.0
2
100
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56
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Percent
Indels
Score
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27
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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20
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
22
14
39
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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