Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  65  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15957414--15957521
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20
0
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39
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0
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1.53
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19
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1.98
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18
2.1
19
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0
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0
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0
0
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128
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28
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3.2
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18
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1.9
26
87
0
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20
8
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36
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3
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1
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27
1.32
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0
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0
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2.0
22
100
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22
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2.9
42
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147
42
19
22
15
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21
3.2
21
68
12
59
47
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19
14
1.83
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2
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1.11
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11
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21
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1
0
32
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
0
32
1.03
16028859--16028918
9
6.2
9
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24
52
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1
0
33
1.03
16028856--16028926
12
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12
71
21
51
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1
1
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1.12
16028873--16028919
21
2.2
23
88
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2
0
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0
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14
86
0
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2
0
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1.11
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1.02
16043414--16043469
21
2.6
21
84
15
71
66
1
0
32
1.03
16043409--16043468
9
6.2
9
75
24
52
65
1
0
33
1.03
16043406--16043476
12
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12
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21
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1
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1.12
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2
0
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1.04
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5
0
32
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18
24
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1.98
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26
4.2
26
92
2
175
33
5
23
36
1.78
16051782--16051890
51
2.1
52
91
1
175
33
5
23
36
1.78
16053669--16053953
135
2.1
137
97
1
538
24
19
24
31
1.98
16057716--16057823
26
4.2
25
91
4
171
34
5
23
37
1.78
16059602--16059887
136
2.1
137
96
0
529
24
19
24
31
1.98
16061324--16061361
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3
100
0
76
34
0
0
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0.93
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3
11.0
3
100
0
66
33
33
0
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16067471--16067497
14
1.9
14
100
0
54
25
44
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7
1.79
16068270--16068409
43
3.3
42
78
8
140
28
25
19
27
1.98
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33
2.1
33
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0
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26
26
2.00
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2.8
16
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22
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39
18
14
27
1.90
16075900--16075941
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1.9
23
85
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61
19
26
0
54
1.44
16078298--16078455
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3.7
43
76
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144
33
24
14
27
1.94
16081776--16081905
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2.9
45
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2
174
23
21
28
26
1.99
16084752--16084866
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2.7
42
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167
26
10
29
33
1.89
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4.5
43
74
13
150
28
13
26
30
1.94
16088902--16088932
16
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15
93
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53
29
6
6
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2.0
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30
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26
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17
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1.97
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151
27
21
18
32
1.96
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5.4
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11
132
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22
19
31
1.97
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26
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19
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3.6
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87
2
298
33
15
12
38
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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6
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0
0
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0
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0
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20
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3
7
36
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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55
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32
10
13
43
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16176385--16176746
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0
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24
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0
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10
31
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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