Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  356  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103549253--103549380
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51
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5
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16
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0
0
90
0.44
103551717--103551746
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0
0
90
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4.1
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100
0
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13
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25
26
19
28
1.99
103553818--103554018
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3.3
62
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1
305
25
26
18
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1.98
103553997--103554124
50
2.5
51
87
5
179
26
22
16
34
1.95
103559091--103559116
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0
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0
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31
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0
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1.63
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24
2.0
24
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7
73
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22
2.0
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82
4
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53
2
4
40
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2.1
22
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56
2
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1.9
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1.32
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21
2.1
21
100
0
90
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46
1.68
103569648--103569691
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21
2.3
21
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7
53
54
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2.0
42
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0
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2
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18
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3
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2
0
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173
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1.83
103585648--103585745
46
2.1
46
88
0
142
21
14
22
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103588990--103589076
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4
29
1.21
103589006--103589077
29
2.5
29
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8
76
62
1
4
31
1.23
103589496--103589550
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10
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43
1
0
54
1.10
103589769--103589810
21
2.0
22
85
4
59
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2
4
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2.0
15
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0
0
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2.9
267
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18
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31
1.97
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126
1.9
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379
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17
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1.96
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10.9
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35
1.82
103601323--103601522
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5.4
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12
134
39
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11
35
1.81
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1.9
80
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204
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11
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1.82
103601601--103601721
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2.3
53
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0
152
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15
18
1.88
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44
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20
1.87
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9
4.0
9
88
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54
17
11
0
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17
2.7
18
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69
17
10
0
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1.12
103602456--103602498
13
3.3
13
83
9
52
16
11
0
72
1.13
103605314--103605374
21
2.9
21
79
13
63
34
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18
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1.9
23
87
12
67
65
0
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27
1.16
103606182--103606317
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3.0
45
89
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193
17
20
20
41
1.91
103606182--103606360
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10
190
18
20
20
41
1.91
103606530--103606809
18
15.2
18
71
13
167
35
11
15
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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100
0
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14
17
17
1.79
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15
26
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37
2.2
37
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45
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0
50
1.19
103616319--103616377
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0
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1.17
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19
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1
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1.95
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7
501
25
22
14
37
1.92
103629312--103629820
112
4.6
111
78
8
489
26
21
14
37
1.92
103629312--103629844
37
14.3
38
79
8
490
26
22
14
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103629428--103629844
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23
14
35
1.93
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2.0
39
97
0
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39
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2.1
24
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0
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24
16
1.93
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21
2.0
21
100
0
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4
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1.56
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2
2
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1.26
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1
0
43
1.09
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114
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26
17
26
30
1.98
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0
0
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0
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0
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0
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9
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1.53
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0
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1.55
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0
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1
0
41
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.00
103688822--103688880
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0
0
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1.00
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0
0
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20
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4
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23
0
39
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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5.0
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9
194
34
17
24
23
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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