Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  381  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110800993--110801105
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2.9
38
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1.40
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3.2
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82
40
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3.6
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39
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24
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12
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30
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0
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0
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110826192--110826251
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22
15
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2.0
38
97
0
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22
26
17
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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3
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2
0
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1.16
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17
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74
5
14
5
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39
3.4
39
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20
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28
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0
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2.0
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21
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25
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3.0
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18
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1.95
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5.9
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78
10
50
51
39
0
9
1.34
110908330--110908373
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2.9
15
89
0
70
52
38
0
9
1.33
110914562--110914594
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
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1.45
110914678--110914718
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2.2
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1.30
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46
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560
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23
14
39
1.91
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9
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9
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0
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42
0
23
34
1.54
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2.0
25
96
0
93
52
3
5
37
1.44
110922237--110922304
25
2.5
29
79
18
99
47
7
8
36
1.63
110922242--110922292
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2.0
25
100
0
102
49
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7
35
1.61
110928066--110928217
78
1.9
78
91
0
250
31
21
14
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110928182--110928312
40
3.3
39
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149
35
21
13
29
1.92
110928203--110928319
40
2.9
40
89
0
171
36
20
13
29
1.91
110929968--110929992
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3.1
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100
0
50
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0
0
24
0.80
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149
2.0
149
90
0
482
26
12
25
34
1.92
110935558--110935612
19
2.8
19
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54
3
3
38
1.36
110935599--110935665
28
2.4
29
85
7
86
62
1
0
35
1.04
110935497--110935661
9
18.4
9
75
14
73
62
1
2
33
1.19
110935715--110935770
23
2.4
24
85
8
71
69
0
7
23
1.12
110935729--110935771
11
3.8
11
79
14
52
72
0
4
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1.04
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2.3
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60
40
0
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55
1.19
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2.4
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2
23
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30
1.25
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2.9
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28
1.98
110994714--110994784
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2.0
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2.0
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10
82
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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0
0.90
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
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T
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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0
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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