Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  246  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70025429--70025493
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2.2
29
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0
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29
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27
26
1.97
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29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
70036806--70036830
2
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2
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0
50
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0
0
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2.0
30
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1.97
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2.1
36
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20
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40
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22
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1.99
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80
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29
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39
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4
363
25
28
23
21
1.99
70078566--70078820
79
3.2
78
90
4
363
25
28
23
21
1.99
70078566--70078820
118
2.2
119
89
4
383
25
28
23
21
1.99
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46
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22
1.91
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3.2
45
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128
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20
20
1.89
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3.2
33
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2.0
35
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0
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1.8
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28
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21
21
1.98
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14
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29
29
20
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1.98
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93
1.8
93
94
0
306
28
29
21
21
1.98
70123982--70124157
46
3.8
46
79
12
216
29
28
20
21
1.98
70135939--70135988
20
2.5
20
100
0
100
22
16
28
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70149270--70149436
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46
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12
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22
22
28
26
1.99
70152881--70152912
16
2.1
15
94
5
55
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6
0
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1.25
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25
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18
22
24
34
1.96
70156739--70156771
16
2.0
17
88
5
50
48
0
15
36
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15
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12
51
46
0
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35
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3.1
11
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0
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0
40
0.97
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18
2.1
17
89
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54
0
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0
38
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2.0
24
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20
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16
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4.2
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26
22
26
2.00
70177796--70177947
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23
1.98
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29
3.6
29
80
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118
29
31
16
22
1.96
70177796--70177947
57
2.7
57
89
0
205
30
26
19
23
1.98
70177960--70178193
40
5.9
40
90
4
368
26
26
22
24
2.00
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24
11.9
24
97
0
507
20
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25
35
1.95
70192758--70192810
5
10.0
5
80
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41
0
1
56
1.10
70192755--70192811
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9
74
22
59
43
0
1
54
1.10
70192756--70192811
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
70194128--70194166
18
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19
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41
0
10
48
1.37
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39
3.4
39
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112
23
20
28
28
1.99
70194663--70194703
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2.2
19
87
12
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46
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1.53
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5
10.0
5
80
11
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41
0
1
56
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70199201--70199257
8
6.6
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74
22
59
43
0
1
54
1.10
70199202--70199257
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
70200574--70200612
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
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3.4
39
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112
23
20
28
28
1.99
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19
2.2
19
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46
0
24
29
1.53
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11.6
51
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12
27
27
1.93
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24
3.2
24
62
23
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28
13
32
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1.93
70203741--70204288
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3.7
149
95
0
933
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12
28
27
1.93
70203714--70204286
98
5.8
100
86
5
783
32
12
27
27
1.93
70203993--70204068
24
3.2
24
62
23
61
28
13
32
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1.93
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4.0
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26
19
28
26
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30
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20
23
1.98
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3.9
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159
28
25
16
28
1.97
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24
2.5
24
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34
27
16
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1.95
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28
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21
28
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1.99
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2.5
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28
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93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
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15
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15
83
3
84
13
17
11
57
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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29
28
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0
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1.98
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39
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0
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1.98
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20
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2.0
221
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1
0
36
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70346345--70346569
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0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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