Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  247  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70397591--70397634
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2.1
21
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0
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1.82
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0
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0
240
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2.0
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22
1.99
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1.99
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11
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12
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94
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5
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28
17
29
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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3.7
46
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18
29
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1.97
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2.00
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24
29
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1.99
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138
26
23
27
22
2.00
70527052--70527240
80
2.4
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77
4
186
23
24
29
22
1.99
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4.4
38
82
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32
1.98
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21
20
25
32
1.98
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2.1
25
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1.97
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22
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1.99
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16
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5.0
54
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2
317
24
19
18
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1.93
70532652--70532918
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3.3
80
85
5
333
24
19
18
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1.94
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13.7
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222
27
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40
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80
80
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194
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8
23
37
1.84
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107
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438
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28
1.83
70533109--70533396
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134
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21
28
1.83
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2.5
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29
33
15
22
1.94
70540271--70540372
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100
29
33
15
21
1.94
70543124--70543307
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4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70543164--70543352
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186
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29
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1.99
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2.7
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19
24
28
1.99
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1.9
85
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25
20
25
28
1.99
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2.9
14
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201
24
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1.95
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5.1
45
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224
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1.93
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2.0
90
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261
27
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1.20
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28
2.0
28
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0
67
23
3
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.10
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4.8
48
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27
1.97
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26
1.98
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2.3
71
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206
26
14
26
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
24
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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0
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19
23
46
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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