Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  47  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11428127--11428173
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0
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0
0.61
11428127--11428173
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0
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0
0.61
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2.7
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19
24
26
1.98
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2.3
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11431150--11431248
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5.6
18
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4
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2
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0.93
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20
2.0
20
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24
3.0
24
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5
2
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16
5.4
16
72
16
58
56
4
3
35
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22
2.0
22
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52
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1.49
11462340--11462398
22
2.7
21
82
15
59
57
6
3
32
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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2.5
15
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0
0
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40
1.30
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89
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2.0
22
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2
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1
413
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19
33
26
1.97
11477198--11477453
130
2.0
131
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2
417
21
19
33
26
1.97
11477198--11477453
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424
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1.97
11477522--11477602
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26
20
26
1.99
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20
2.8
20
83
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69
33
23
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1.95
11489007--11489050
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161
38
0
13
47
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11491406--11491649
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18
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188
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1.48
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112
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311
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1
12
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1.48
11491406--11491680
150
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149
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408
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1
12
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1.49
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24
2.8
24
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3.5
321
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183
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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32
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23
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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137
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0
520
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18
24
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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180
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1.94
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2
0
64
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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