Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  59  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Period
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Copy
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Score
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
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Indices
Period
Size
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14556393--14556448
24
2.3
24
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0
103
16
19
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21
1.89
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11
2.4
11
100
0
52
84
0
7
7
0.77
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27
2.0
27
85
3
72
64
3
9
22
1.40
14568090--14568179
22
3.9
22
83
4
99
30
15
15
38
1.89
14568087--14568157
23
3.0
23
81
6
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29
16
14
39
1.88
14568087--14568180
45
2.0
47
88
8
140
28
14
14
41
1.86
14576234--14576264
15
2.1
15
93
0
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25
9
6
58
1.54
14579449--14579481
4
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4
93
0
57
24
0
3
72
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14579455--14579505
16
3.2
16
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10
52
21
1
3
72
1.11
14599528--14599566
20
2.0
20
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10
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10
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25
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20
2.0
20
85
10
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10
33
25
30
1.89
14611517--14611564
1
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1
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0
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0
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0
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0
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0
91
0.41
14611517--14611564
19
2.8
17
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9
71
0
8
0
91
0.41
14611689--14611919
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2.0
118
92
0
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28
31
17
22
1.97
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5
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5
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14
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0
0
21
0.74
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20
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10
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78
0
0
21
0.75
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7
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7
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0
0
20
0.74
14612875--14612934
23
2.8
20
79
18
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0
0
20
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6
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0
0
13
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3.6
19
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8
118
36
12
13
37
1.82
14624375--14624412
17
2.5
15
80
19
51
39
10
15
34
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14625040--14625077
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2.0
19
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15
5
7
71
1.28
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3.4
45
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23
1.96
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2.5
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17
23
26
1.97
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155
32
17
23
26
1.97
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175
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0
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20
27
1.97
14632268--14632310
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2.2
20
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37
9
18
34
1.83
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1.83
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1.50
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0
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0
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1.98
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100
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2.0
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16
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3.1
31
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6.0
24
90
4
200
27
22
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14671312--14671453
47
3.0
48
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5
198
27
22
21
28
1.99
14671311--14671454
71
2.0
72
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4
211
27
22
21
29
1.99
14671505--14671564
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3.0
20
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0
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27
7.9
27
85
5
250
38
8
24
28
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427