Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  19  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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181
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0
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0
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2.0
164
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4
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126
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14
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50
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11
4
16
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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2.0
100
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2.1
27
100
0
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7
3
42
1.48
5315590--5315642
12
3.6
16
69
26
53
43
9
3
43
1.55
5317982--5318040
27
2.2
27
96
3
111
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18
13
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100
0
78
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0
0
1.00
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2.2
22
78
7
55
30
2
2
65
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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25
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0
38
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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27
2.6
27
100
0
138
13
56
23
7
1.61
5356562--5356615
17
3.6
17
65
31
50
16
57
20
5
1.59
5357008--5357042
15
2.3
15
95
0
61
5
0
31
62
1.18
5357038--5357073
16
2.3
15
90
4
54
0
8
2
88
0.59
5357719--5358795
88
13.0
81
69
19
310
33
19
18
28
1.95
5357887--5357948
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
5358073--5358312
77
3.1
78
83
5
290
34
17
17
30
1.94
5358483--5358810
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4.1
75
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18
227
30
20
20
28
1.97
5358155--5359083
333
2.9
329
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7
1214
31
20
19
28
1.97
5358155--5358865
167
4.3
165
92
1
1136
31
20
19
28
1.97
5358559--5358734
92
2.0
89
87
6
257
32
19
19
28
1.96
5358814--5358917
52
2.0
53
90
3
165
29
29
19
21
1.97
5358867--5359089
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3.0
73
84
8
315
31
21
17
29
1.96
5358864--5359097
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3.1
73
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8
337
32
21
17
29
1.96
5366028--5366062
2
17.5
2
93
0
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51
2
0
45
1.16
5366561--5366590
11
2.7
11
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0
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0
0
40
0.97
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27
2.6
27
100
0
138
13
56
23
7
1.61
5366980--5367033
17
3.6
17
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31
50
16
57
20
5
1.59
5367430--5367464
15
2.3
15
95
0
61
5
0
31
62
1.18
5367460--5367495
16
2.3
15
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4
54
0
8
2
88
0.59
5370980--5371017
18
2.1
18
90
0
58
42
21
15
21
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5371243--5371267
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1.9
13
100
0
50
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48
0
12
1.40
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6
6.5
6
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10
55
78
2
0
19
0.87
5371292--5371333
20
2.1
20
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0
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2
0
19
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2
13.5
2
100
0
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0
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0
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1.00
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0
0
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1.56
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27
23
23
2.00
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18
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0
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1.94
5423357--5423449
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0
141
33
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21
30
1.94
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2.1
16
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28
0
3
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1.04
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2.1
137
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538
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1.98
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5.2
26
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227
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1.78
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0
20
0
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9
4.8
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40
4
0
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1.21
5445528--5445572
18
2.5
18
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40
4
0
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1.20
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29
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1
5
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1.28
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17
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21
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0
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1.20
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2
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1.30
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1.9
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27
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65
1.27
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100
32
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25
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1.60
5445959--5446053
26
3.8
26
76
12
85
34
6
6
52
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5446008--5446068
20
2.9
21
80
9
79
34
4
4
55
1.43
5446024--5446101
22
3.5
22
73
15
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35
2
5
56
1.35
5446098--5446151
26
2.1
26
83
13
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33
1
5
59
1.31
5446201--5446232
2
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2
100
0
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0
0
50
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0
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0
0
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1.00
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0
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1.89
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21
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0
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2.0
22
83
8
56
31
2
6
60
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427