Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  35  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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249
16
19
29
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8904944--8905125
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19
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2.1
56
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2
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20
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24
2.4
23
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60
17
17
26
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1.93
8937817--8937978
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4.1
39
83
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175
18
19
28
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
77
0.93
8947878--8947980
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12
101
17
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0
77
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2.0
118
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2
75
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
8962602--8962692
48
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47
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10
123
17
5
3
73
1.16
8962698--8962738
21
2.0
21
85
9
57
19
0
4
75
0.98
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21
3.0
20
83
11
70
42
1
1
54
1.20
8962811--8962864
21
2.5
21
87
3
72
42
1
1
53
1.22
8962831--8962923
41
2.3
40
88
5
143
33
2
0
64
1.06
8962830--8962902
20
3.4
21
69
7
67
36
2
0
60
1.11
8962831--8962923
40
2.3
41
90
7
147
33
2
0
64
1.06
8962897--8962950
11
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11
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4
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14
5
0
79
0.90
8963162--8963230
17
4.1
16
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23
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55
1
1
42
1.18
8963131--8963245
9
12.2
9
68
23
60
56
1
0
40
1.15
8963236--8963273
20
1.9
20
89
10
60
52
0
2
44
1.14
8963210--8963288
32
2.5
31
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10
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53
1
2
43
1.22
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35
1.9
35
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0
89
47
2
5
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1.43
8976597--8976635
19
2.0
20
90
5
62
48
7
0
43
1.31
8982076--8982114
18
2.1
19
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13
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2
2
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1.23
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29
2.3
29
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30
4
1
63
1.23
8983174--8983239
27
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28
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10
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1
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1.23
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13
100
0
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16
2.1
17
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5
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0
0
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39
2.2
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18
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2
0
50
1.14
8984538--8984574
2
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0
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0
0
48
1.00
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35
2.0
35
97
0
129
26
17
21
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
2.1
19
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5
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60
5
0
34
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21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
9003211--9003250
2
19.5
2
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5
0
47
1.24
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19
1.9
19
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5
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0
0
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0
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0
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0
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0
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7
7
29
1.55
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23
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1.38
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12
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15
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0
0
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0.95
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12
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2
0
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1.09
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1
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0
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22
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2.5
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9
90
9
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1.60
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0
1
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0.90
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26
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2.0
24
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2
100
0
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0
0
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3.4
16
82
5
67
60
0
1
38
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9034090--9034201
43
2.6
43
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1
152
31
29
16
23
1.96
9035647--9035679
15
2.1
16
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5
59
36
6
3
54
1.41
9038761--9038884
25
5.3
25
78
14
156
42
3
45
8
1.51
9038793--9038878
21
3.9
21
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11
109
47
1
43
8
1.40
9038768--9038884
46
2.5
46
98
0
225
44
2
44
8
1.48
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2.5
20
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26
2
0
71
0.97
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0
0
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104
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0
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1.98
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0
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18
2.4
18
88
0
70
25
22
34
18
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427