Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  416  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120922594--120922682
10
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9
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2
1
43
1.20
120922594--120922682
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73
12
63
52
2
1
43
1.20
120922570--120922696
29
4.3
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7
110
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2
2
43
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120922652--120922740
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2.7
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1
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2.5
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75
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1
0
45
1.10
120922676--120922746
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0
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38
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5
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16
1.21
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26
2.4
28
81
7
78
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50
1.27
120939101--120939166
27
2.5
26
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78
43
1
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51
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21
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2
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40
1.11
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23
4.1
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2
0
42
1.12
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0
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3.8
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0
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9
0.90
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80
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16
2.1
16
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2.0
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48
0
2
48
1.16
120956291--120956322
14
2.3
14
94
0
55
37
0
3
59
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
27
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0
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27
29
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120958222--120958605
104
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100
79
12
344
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1
16
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1.52
120958318--120958605
100
2.8
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363
29
1
16
53
1.50
120959016--120959058
19
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21
87
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0
0
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3.4
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20
15
4
59
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120962349--120962462
47
2.4
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2
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21
15
4
57
1.55
120962366--120962440
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3.2
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17
84
21
14
5
58
1.56
120962374--120962450
26
3.2
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27
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0
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0
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0
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68
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97
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13
23
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18
3.3
18
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50
59
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6
32
1.34
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1.9
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100
0
134
55
2
7
34
1.43
121016217--121016288
35
2.2
30
81
15
90
54
2
9
33
1.48
121016234--121016313
35
2.3
35
85
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101
58
2
8
30
1.41
121022154--121022211
20
3.0
19
78
9
55
48
1
3
46
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121022176--121022216
19
2.1
20
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4
57
51
2
2
43
1.28
121023570--121023621
21
2.4
21
81
9
61
57
7
1
32
1.38
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1.9
16
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35
1.12
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0
278
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20
38
1.85
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2.2
21
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85
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10
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21
1.81
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2.8
29
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15
98
27
7
6
59
1.48
121049539--121049589
18
3.1
16
76
15
50
31
7
50
9
1.64
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2.0
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0
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2.1
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30
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11
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28
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1.94
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0
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23
1.71
121102708--121102759
26
2.0
26
96
0
95
21
19
25
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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0
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38
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2.2
27
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3
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42
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2.1
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5
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6
0
24
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23
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12
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1
1
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1.18
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20
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9
57
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2
2
44
1.24
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15
3.5
15
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5
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49
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13
23
1.78
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2.8
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4
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29
27
16
25
1.97
121118013--121118163
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2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
121124435--121124526
30
3.2
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2
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1.34
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27
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1
3
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1.23
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9
0
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0
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27
16
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1.96
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1.9
88
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1.98
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4.7
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1.98
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26
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1.99
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7.3
132
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19
22
22
35
1.96
121140738--121141700
261
3.7
261
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1
1594
19
22
22
35
1.96
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2.5
394
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8
1375
19
21
22
35
1.96
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3.5
42
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7
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19
22
22
35
1.96
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2.4
86
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0
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19
22
21
35
1.96
121141710--121141861
44
3.5
44
69
7
139
19
25
20
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121141273--121142002
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2.4
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21
22
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1.96
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1.97
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3.4
139
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0
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1.97
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3.4
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23
1.99
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0
0
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27
20
23
1.99
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0
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0
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2.2
22
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0
0
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2.0
21
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0
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29
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14
70
17
51
24
17
13
44
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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0
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0
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7.1
57
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2
652
17
17
35
29
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427