Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  375  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108998876--108998975
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1.9
52
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2
146
18
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28
24
1.97
108999472--108999537
23
2.9
23
88
2
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36
1.60
109012726--109012775
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2
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0
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318
3.0
317
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3
1507
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109029673--109029818
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3.4
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28
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109030866--109030895
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0
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0
0
50
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23
23
28
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20
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22
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13
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23
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26
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220
36
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1.77
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3.0
39
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0
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20
20
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2.1
78
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205
21
20
30
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1.98
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25
2.7
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2
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23
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1.99
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22
2.2
21
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3
78
29
22
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0
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45
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6
40
1.57
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42
1.63
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2.3
20
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24
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234
2.0
234
98
0
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15
16
30
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0.90
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0
32
1.58
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13
2.1
13
100
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31
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29
1.94
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2.3
42
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1
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31
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27
1.96
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20
2.3
20
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2
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1.69
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7.1
46
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3
451
18
22
14
45
1.85
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33
4.7
33
70
15
106
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1.98
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13
2.9
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0
13
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0
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11
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100
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0
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14
1.9
14
100
0
54
62
7
0
29
1.22
109159605--109159646
7
5.9
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78
15
50
69
0
2
28
1.01
109159605--109159646
15
2.9
15
85
3
59
69
0
2
28
1.01
109159657--109159683
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3
29
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30
1.9
30
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6
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56
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10
24
1.60
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20
2.9
18
73
21
58
40
0
1
58
1.09
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23
1.9
23
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9
63
38
0
2
59
1.10
109161533--109161588
15
3.7
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77
15
53
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5
26
1
1.23
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100
0
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18
18
14
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1.82
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3
8.7
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100
0
52
65
0
0
34
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109166880--109166948
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4.6
14
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18
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63
2
0
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1.09
109166894--109166951
17
3.6
17
75
17
61
63
3
0
32
1.11
109168148--109168247
35
3.1
30
74
14
92
52
1
2
45
1.19
109171387--109171437
10
4.9
10
75
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50
50
0
0
49
1.00
109171399--109171448
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54
0
0
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1.00
109171405--109171457
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76
19
51
50
0
0
49
1.00
109171396--109171457
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2.7
23
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51
0
0
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1.00
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0
0
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0
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1.22
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0
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21
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0
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0
0
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19
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51
0
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0
8
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1.32
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21
2.0
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2
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29
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8
76
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15
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46
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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109238295--109238373
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39
0
12
48
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
37
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.77
109310500--109310655
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1.77
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0
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1.98
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0
367
26
25
12
35
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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