Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  219  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61810677--61810842
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2.2
77
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5
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15
20
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1.94
61810336--61811145
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170
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12
744
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17
18
34
1.94
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1.8
251
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2.1
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24
10
0
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1.25
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19
1.9
19
88
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0
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2.0
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2
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2
88
0
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50
2
2
44
1.30
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29
2.6
29
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105
25
16
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1.96
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29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
61847818--61847891
29
2.6
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15
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1.98
61854142--61854461
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3.4
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304
25
18
30
24
1.98
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0
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34
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2.4
28
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0
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17
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48
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26
18
20
1.96
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188
1.9
188
87
2
523
33
26
19
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61868060--61868195
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11
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14
1
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1.44
61868066--61868195
5
24.2
5
72
18
84
24
14
1
59
1.44
61868048--61868100
23
2.3
23
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30
15
0
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1.41
61868060--61868152
23
4.0
22
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20
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23
16
0
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2.8
28
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16
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23
14
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60
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16
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59
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9
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5
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6
69
13
64
30
15
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52
1.51
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22
2.8
22
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7
92
28
17
1
52
1.54
61869146--61869179
12
2.8
12
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16
52
26
20
0
52
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27
2.4
28
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9
48
1.51
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14
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14
94
0
57
36
0
3
60
1.12
61877588--61877617
14
2.1
15
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6
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0
0
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25
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30
1.39
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2.2
23
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61882899--61882965
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55
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5
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1.34
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1.9
60
94
0
199
21
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1.96
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2.0
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12
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1.9
46
86
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126
13
26
13
46
1.80
61895580--61895762
40
4.7
39
85
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230
24
22
27
25
2.00
61895580--61895762
77
2.3
80
84
8
232
24
22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61903600--61903781
40
4.6
39
84
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228
24
21
27
25
2.00
61903601--61903781
77
2.3
80
83
10
230
24
22
27
25
2.00
61908605--61908671
22
3.1
22
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14
59
59
10
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2
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100
0
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0
0
50
1.00
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1.39
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1.72
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2
37.5
2
73
16
53
39
2
1
56
1.23
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3.0
27
74
9
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38
5
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53
1.36
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25
2.5
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10
68
33
8
6
50
1.59
61910607--61910655
25
2.0
25
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0
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1.57
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61910810--61910862
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1
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14
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0
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1.95
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4.3
220
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28
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1.95
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153
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22
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19
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1.95
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4.3
77
85
5
348
25
19
19
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
3
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4.8
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1
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48
4
20
1.68
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27
2.9
27
77
12
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5
2
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1.35
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25
2.9
24
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2
1
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1.22
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2.5
24
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8
6
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1.59
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25
2.0
25
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0
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1.57
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16
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15
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2
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61924173--61924224
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1.96
61939916--61940074
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1.96
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1.96
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18
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2.4
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26
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25
1.98
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201
25
29
18
26
1.98
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3
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25
29
17
27
1.98
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15
27
1.96
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3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
28
1.98
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1.8
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27
1.98
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35
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1.84
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1.85
61987611--61987796
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20
23
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62047151--62047214
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31
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27
1.99
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1.98
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1.96
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1.96
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1.98
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2.5
20
75
0
53
24
18
20
36
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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