Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  267  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76798011--76798089
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124
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2
536
36
26
19
17
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1
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21
67
21
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1
2
48
1.25
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2.2
107
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1
445
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2
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1.23
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20
2.5
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50
0
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46
1.20
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2
2
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2.6
87
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2
399
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2
2
45
1.26
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1
3
50
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2.0
147
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1
551
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2
2
46
1.28
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22
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0
0
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0
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1.28
76873199--76873247
17
2.9
17
85
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73
28
0
10
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1.29
76873199--76873287
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0
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35
1.64
76876849--76876974
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18
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45
15
3
35
1.64
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74
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2
257
45
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3
35
1.63
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100
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2.0
329
99
0
1298
26
17
19
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76878512--76879141
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2.8
229
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20
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1.96
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3.5
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30
27
15
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1.96
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2.1
14
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34
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10
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
30
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0
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15
27
31
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1.96
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0
2
13
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26
24
2.00
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28
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25
2.00
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22
27
2.00
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40
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20
26
26
1.99
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1.99
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26
1.98
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303
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1.98
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26
1.99
76966372--76967475
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2
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26
1.98
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26
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26
1.98
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24
2.00
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28
23
24
2.00
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8
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32
21
2
43
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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23
26
24
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77036613--77036675
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26
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1.96
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2.3
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0
321
28
17
29
24
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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