Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  21  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.6
26
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3.9
39
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19
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3.6
132
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1
686
26
23
17
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.97
5811068--5811543
132
3.6
132
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686
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23
17
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1.97
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203
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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5
47
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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53
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27
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26
1.97
5901875--5902015
27
5.3
26
88
5
167
35
22
24
17
1.95
5901875--5902013
54
2.6
55
88
3
194
35
22
24
17
1.96
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26
2.8
27
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4
91
30
11
22
35
1.90
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26
4.2
26
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0
175
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1.9
20
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0
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80
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0
0
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2.0
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0
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0
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27
22
14
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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25
100
0
100
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12
16
40
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
46
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0
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4
0
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0
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0
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