Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  389  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112893557--112893602
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2.2
21
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2
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112893643--112893900
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2
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1.30
112893688--112893769
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0
0
50
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100
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1.9
202
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321
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19
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2.0
118
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100
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1.9
30
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10
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2.0
25
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4
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38
0
18
44
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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43
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21
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25
21
1.98
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3.7
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26
21
1.98
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1.9
76
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1.99
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1.99
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22
24
1.83
112968698--112968750
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2.5
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135
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0
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1
60
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112992795--112992843
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2.0
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2
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1.24
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2.1
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89
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1.97
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110
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23
16
1.90
113047330--113047559
79
2.9
79
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3
295
20
9
25
45
1.81
113048256--113048326
20
3.5
20
80
5
63
39
32
7
21
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113048256--113048333
21
3.8
19
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42
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6
20
1.77
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78
2.2
79
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2
229
27
27
23
20
1.99
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5.7
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4
206
27
27
23
21
1.99
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39
4.9
40
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2
214
27
27
23
20
1.99
113058121--113058527
75
5.4
75
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1
487
26
20
21
31
1.98
113058165--113058527
149
2.4
150
84
2
480
27
19
21
31
1.97
113058182--113058447
40
7.1
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22
123
26
19
21
32
1.97
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29
2.8
29
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10
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52
4
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31
1.58
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24
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0
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0
1.00
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0
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0
0
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1.00
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1.26
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2.0
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0
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0
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1
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113088991--113089161
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1.9
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23
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113097611--113097656
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5
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2
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17
0
0
82
0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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22
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21
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0
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0
0
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28
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1.98
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28
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1.99
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36
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0
0
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0
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0
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0
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20
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1.97
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0
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1.80
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1.27
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2.2
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81
10
94
41
3
2
52
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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129
2.0
128
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0
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24
1.84
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0
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0
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17
2.0
18
88
5
54
37
11
2
48
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427