Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  138  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37251182--37251237
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2.1
26
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23
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30
1.81
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5
140
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20
9
28
1.83
37251158--37251528
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54
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186
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20
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1.85
37251372--37251500
27
4.7
27
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2.9
27
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39
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18
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2.8
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0
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1
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22
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24
1.98
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31
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17
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1.98
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33
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24
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40
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1.99
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143
25
28
22
24
1.99
37258156--37258305
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1.9
78
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196
24
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22
26
1.99
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17
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19
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22
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34
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17
23
1.96
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4.2
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1.99
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17
2.5
19
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22
53
34
23
17
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1.96
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29
4.4
29
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1
100
25
31
17
25
1.97
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58
2.2
58
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2
145
25
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16
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1.97
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2.2
12
100
0
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0
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2.3
71
100
0
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18
28
17
35
1.94
37296470--37296667
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
328
18
28
17
35
1.94
37303565--37303762
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
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3.6
29
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2
143
27
15
32
24
1.96
37314383--37314485
29
3.6
29
87
0
143
28
15
32
24
1.95
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5.6
40
96
0
401
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22
27
27
1.99
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40
3.5
40
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23
28
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1.84
37334815--37335100
94
3.0
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457
34
6
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30
1.84
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0
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17
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26
1.98
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100
0
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0
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0
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0
1
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15
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58
0
3
38
1.15
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2.0
33
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16
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1.94
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101
23
16
24
35
1.95
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3.6
29
80
2
109
22
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29
1.96
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48
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203
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16
26
30
1.97
37411606--37411652
22
2.1
22
85
14
62
25
8
17
48
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37413326--37413392
20
3.3
20
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4
91
40
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17
32
1.81
37413442--37413564
26
4.8
25
83
1
138
29
21
21
27
1.99
37413442--37413572
52
2.6
51
86
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180
31
20
20
27
1.98
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2.2
42
90
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139
30
14
20
34
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196
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27
1.97
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5
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1.05
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25
2.00
37436892--37437042
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1.9
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82
4
189
23
23
27
25
2.00
37436892--37437072
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23
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26
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1.87
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14
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5
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0
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
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0
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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35
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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