Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  296  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85677645--85677670
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12
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0
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23
24
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85687948--85688114
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2.1
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205
23
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22
26
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3.2
39
82
4
159
25
26
23
25
2.00
85691951--85692101
40
3.8
39
81
6
153
22
27
23
27
1.99
85691937--85692101
80
2.1
79
83
7
201
23
26
23
27
2.00
85700820--85700862
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2.5
30
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2.0
20
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4.1
51
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0
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2.1
51
89
0
158
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23
17
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1.97
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3.7
45
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21
21
28
28
1.99
85782045--85782213
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1.8
92
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2
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21
28
27
1.99
85789152--85789321
46
3.7
46
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12
206
21
21
28
28
1.99
85789148--85789316
92
1.8
92
93
2
295
21
21
29
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1.98
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2.1
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18
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1.97
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10.6
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0
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13
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1.96
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134
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0
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15
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2.0
20
100
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17
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3
41
1.33
85811136--85811271
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2.0
29
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1.94
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1.8
126
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0
325
32
22
18
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85823531--85823574
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2
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3
17
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0
0
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0
0
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1.00
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2.0
26
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258
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6
0
37
1.27
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20
4.8
20
69
17
70
43
1
2
52
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.54
85899523--85899659
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1.55
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20
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1.99
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1.9
153
88
0
448
20
30
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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28
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3.0
30
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27
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2.6
24
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10
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20
22
20
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85987663--85987778
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24
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1.70
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1.96
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1.97
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2.8
46
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8
136
25
22
18
33
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427