Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  262  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75352800--75353002
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2.4
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1.93
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18
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1.8
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28
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2.0
20
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15
53
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23
0
36
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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28
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1.8
92
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304
28
28
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21
1.98
75463406--75463593
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4.1
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28
20
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1.98
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2.0
30
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26
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1.99
75519848--75519990
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3.0
20
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20
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24
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27
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1.99
75533447--75533621
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216
25
21
28
25
1.99
75544415--75544595
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235
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22
28
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1.99
75544416--75544598
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1.99
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17
0
70
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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42
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29
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1.06
75570894--75570968
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32
1.82
75630131--75630298
27
6.3
27
84
6
207
33
20
21
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
22
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9
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21
21
21
34
1.97
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27
3.2
27
82
8
88
20
21
19
37
1.94
75631209--75631305
6
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6
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1.83
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1
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18
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1.78
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19
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1.81
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2
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2
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0
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0
0
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1.00
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1.56
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0
0
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1.14
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38
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47
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1
457
27
28
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1.86
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140
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453
27
28
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1.86
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3.3
41
78
10
126
30
26
7
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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26
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29
1.97
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58
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2
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1
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1.97
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1.98
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1.95
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3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75734032--75734195
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71
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0
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1.95
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2.2
95
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5
210
28
20
26
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427