Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  292  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84343560--84343711
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2.1
57
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211
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0
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18
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177
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18
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24
1.98
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2.0
23
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1.76
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18
2.4
18
100
0
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1.64
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1.97
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159
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29
19
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1.98
84387281--84387452
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1.8
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224
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1.99
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1.92
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3.2
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24
63
28
13
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23
1.92
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3.3
25
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22
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31
10
28
30
1.89
84393518--84393593
23
3.2
25
62
24
63
28
13
34
23
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
101
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220
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11
33
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19.5
2
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0
2
48
1.15
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3.1
32
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22
15
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24
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26
22
22
28
1.99
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47
3.0
48
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207
26
22
22
28
1.99
84405447--84405590
71
2.0
72
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4
220
26
22
22
29
1.99
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20
10
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1.9
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25
16
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3.1
31
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1.95
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24
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200
26
22
21
28
1.99
84413604--84413744
46
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48
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198
26
22
21
28
1.99
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20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
84413796--84413850
11
5.4
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55
30
20
10
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84413898--84413945
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1.9
25
86
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69
25
16
25
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1.96
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3.2
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1.98
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2.3
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2.0
24
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22
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25
2
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68
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84436961--84437011
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2.3
20
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72
0
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1.10
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2.7
27
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1.77
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37
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131
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1.74
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10.5
6
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1
26
1.14
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5.5
11
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1.17
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1.97
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1.98
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22
22
29
1.99
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20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84520685--84520739
11
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16
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30
20
10
38
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1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
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31
3.5
35
89
9
135
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23
16
37
1.94
84527533--84527627
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
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24
6.0
24
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4
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26
22
22
28
1.99
84527819--84527960
47
3.0
48
90
5
207
26
22
22
28
1.99
84527818--84527961
71
2.0
72
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4
220
26
22
22
29
1.99
84528012--84528071
20
3.0
20
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0
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33
20
10
36
1.86
84528012--84528066
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5.4
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20
10
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1.87
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1.9
25
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0
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25
16
25
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1.96
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2.1
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2
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1.70
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2.4
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5
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27
15
1.96
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0
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21
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22
1.99
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1.9
119
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25
22
28
22
1.99
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2.2
26
77
11
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26
26
11
35
1.91
84552367--84552438
28
2.6
28
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0
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29
27
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30
1.93
84561231--84561321
40
2.3
40
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0
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31
25
23
19
1.98
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2.3
80
78
12
197
26
23
27
23
2.00
84567412--84567516
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2.2
50
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14
23
24
1.92
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4.8
55
80
10
275
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25
22
1.94
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1.9
109
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320
33
17
25
24
1.96
84569819--84569865
24
1.9
25
82
4
60
44
8
23
23
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84581450--84581634
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27
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24
1.99
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4.2
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4
243
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28
21
22
1.99
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2.6
21
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18
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1.93
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47
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15
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1.95
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2.7
44
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26
16
27
1.97
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29
3.3
29
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0
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26
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1.94
84605292--84605408
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2.0
58
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0
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1.95
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201
25
32
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1.95
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1.99
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0
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28
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0
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0
0
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0
0
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0
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1.91
84667765--84667870
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2.1
52
94
1
187
35
24
6
33
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84667765--84667870
26
4.1
26
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2
178
35
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33
1.81
84672696--84672748
26
2.0
27
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7
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24
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37
1.92
84674224--84674330
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4.2
26
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2
180
36
24
6
32
1.81
84674224--84674330
51
2.1
52
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189
36
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6
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1.81
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25
2.00
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0
0
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1.99
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3.0
64
58
16
142
33
26
11
28
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427