Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  75  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18557401--18557576
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20
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1.8
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0
317
20
21
29
27
1.98
18564984--18565159
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
18564981--18565152
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
18573687--18573726
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0
0
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18573714--18573771
19
2.9
19
85
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32
0
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63
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32
1
5
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1.29
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2.5
19
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0
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19
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0
0
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0
0
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101
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0
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29
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1.9
66
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0
169
32
21
24
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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23
21
1.88
18593121--18593167
24
2.0
23
91
4
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10
4
36
48
1.57
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2.1
19
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2
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1.09
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0
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0
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1.97
18637232--18637370
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1.9
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15
23
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1.95
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2
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231
31
26
12
30
1.92
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2.1
19
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2.3
15
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54
25
5
0
68
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18669504--18670608
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2
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44
2.1
44
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5
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1.79
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16
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87
28
28
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100
0
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13
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60
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20
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71
63
3
8
24
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18695653--18695742
40
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40
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3
8
24
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18695657--18695725
19
3.8
17
70
20
50
60
4
8
26
1.44
18697357--18697456
43
2.3
43
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3
130
21
22
21
36
1.96
18709737--18709766
14
2.1
15
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63
10
13
13
1.52
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19
6.1
19
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15
74
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3
2
37
1.31
18709843--18709945
11
9.3
11
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21
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56
3
2
36
1.33
18709875--18709939
30
2.1
32
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1
1
38
1.17
18709889--18709939
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0
1
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0
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3
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3
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0
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0
0
33
0.92
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9
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9
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58
0
6
35
1.24
18710459--18710518
3
19.7
3
76
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59
58
0
6
35
1.24
18710573--18710662
20
4.6
20
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3
8
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1.39
18710577--18710645
19
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4
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26
1.44
18715857--18715897
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2.1
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0
2
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29
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0
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49
100
0
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2.1
99
97
2
385
35
5
21
37
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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24
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2.3
22
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3
57
30
4
18
48
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18765057--18765552
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107
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1
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126
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16
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1.90
18765639--18766140
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2.0
251
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16
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2
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3.6
42
75
7
130
32
18
20
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427