Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  324  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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89
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301
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1.98
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50
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28
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2.1
18
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0
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16
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3.5
172
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17
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19
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1
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2.1
28
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0
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1
0
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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21
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1
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1.9
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86
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24
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2.4
17
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9
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22
22
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2.2
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32
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3.2
20
81
12
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28
7
0
63
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94608839--94608962
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2.2
27
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55
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18
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1.20
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9
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1.23
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40
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0
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36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
1951
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28
1.51
94653520--94654798
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302
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2
1996
57
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6
28
1.51
94653520--94654798
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2.0
20
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28
17
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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55
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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