Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  368  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106763778--106763828
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3.5
15
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5
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0
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0
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28
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106776696--106776867
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177
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0
0
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3.6
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98
29
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1.95
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2.2
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50
0
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85
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2.0
21
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21
29
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0
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0
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15
2.5
15
87
8
51
28
5
5
60
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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53
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1.9
83
82
2
199
36
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17
27
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15
2.1
15
94
0
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9
6
15
1.36
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1.9
21
90
5
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0
0
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83
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1
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2.0
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27
4
0
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2.3
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2
26
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13
5.2
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81
14
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7
0
52
39
1.31
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3
139
12
0
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34
1.39
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15
1.9
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10
3
33
53
1.51
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3.3
206
91
1
1049
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22
18
30
1.97
106884597--106884681
23
3.6
23
69
10
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29
1.42
106884627--106884708
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102
52
0
13
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1.41
106884693--106884734
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57
69
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2
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2.0
22
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15
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54
6
4
37
51
1.49
106886091--106886129
10
3.9
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17
7
2
71
1.21
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15
1.9
16
93
6
53
30
3
0
66
1.07
106893260--106893290
16
1.9
16
93
0
53
16
3
12
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1.35
106893525--106893570
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32
0
0
67
0.91
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18
1.9
18
94
0
61
48
14
11
25
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106913867--106913905
11
3.5
11
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53
5
15
0
79
0.90
106917987--106918019
15
2.1
17
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11
52
54
6
0
39
1.25
106921402--106921469
35
1.9
36
87
3
102
51
4
5
38
1.46
106921410--106921480
35
2.0
35
83
5
90
52
5
5
36
1.49
106921544--106921578
16
2.1
17
89
5
54
51
25
0
22
1.48
106921545--106921580
18
1.9
19
88
5
56
52
25
0
22
1.47
106921588--106921678
22
4.2
22
81
12
100
58
3
4
34
1.34
106921588--106921678
21
4.2
21
81
14
89
58
3
4
34
1.34
106921588--106921704
21
5.6
20
76
15
87
58
2
4
34
1.31
106921903--106921934
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1.9
16
93
6
55
53
12
0
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3
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19
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6
30
1.36
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17
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3
14
5
1.08
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57
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1.41
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0
46
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10
44
1.77
106942227--106942393
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
106942227--106942393
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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34
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17
23
1.96
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4.2
26
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0
189
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2
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0
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0
0
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0
0
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24
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8
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1.50
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0
0
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20.3
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0
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0
0
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29
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1.97
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0
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1.95
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25
18
1.96
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27
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1.95
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28
2.4
27
79
7
69
27
20
23
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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24
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25
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0
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1.9
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0
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47
6
17
28
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107102687--107102738
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2.0
27
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3
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38
1.74
107105517--107105652
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1.96
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0
0
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0
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0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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