Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  404  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117290032--117290067
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0
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0
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3
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15
2.9
15
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14
58
6
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1.55
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2.5
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60
65
5
0
29
1.15
117291246--117291369
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0
0
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0
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2.2
19
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0
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2.7
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20
1
0
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0.85
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131
20
1
0
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0
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29
27
16
26
1.97
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23
2.3
23
96
0
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32
15
3
48
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117331609--117331672
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2.7
23
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94
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0
1
34
1.03
117331640--117331679
17
2.3
18
86
4
55
70
0
0
30
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0
0
24
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2.1
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7
81
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1
66
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1.9
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88
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12
47
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3.1
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21
21
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0
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20
20
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18
1.9
18
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0
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1.57
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2.0
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2
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70
50
0
3
45
1.18
117376693--117376747
14
3.7
14
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50
0
1
47
1.11
117379372--117379481
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2.2
51
94
0
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33
12
22
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1.92
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4.2
51
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1.91
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2.1
102
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403
33
12
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32
1.91
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2.5
54
100
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210
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21
20
1.87
117387835--117388007
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1.9
93
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15
20
19
1.87
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0
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1.00
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21
2.4
21
83
9
59
41
17
9
31
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117422540--117422593
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2.1
26
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59
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5
31
1.38
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2.1
28
100
0
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37
10
20
31
1.86
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2.8
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1
83
42
4
23
29
1.74
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158
1.9
156
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403
37
13
19
29
1.90
117437063--117437101
13
2.9
13
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51
15
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5
76
1.06
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2.2
30
85
0
85
23
6
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55
1.62
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2.0
28
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250
50
7
5
37
1.53
117438325--117438545
118
1.9
118
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282
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28
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1
0
45
1.16
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229
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43
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1.8
96
94
1
314
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7
17
37
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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0
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1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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31
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427