Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  302  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87581359--87581392
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0
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0
0
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0
0
50
1.00
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1.10
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138
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3
0
60
1.15
87581736--87581888
50
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52
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13
129
34
3
1
59
1.27
87588424--87588462
20
2.0
20
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42
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24
16
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87597061--87597143
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25
2.8
25
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2
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25
21
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32
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1.83
87602511--87602734
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4.1
54
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227
31
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19
40
1.82
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27
5.8
27
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224
39
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22
30
1.83
87602704--87602880
81
2.2
81
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22
32
1.83
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1.9
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2
215
37
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21
31
1.85
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3
20.7
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1
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0
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29
2.0
29
96
0
105
29
21
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2.2
26
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1
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1.03
87623928--87624007
27
3.0
27
74
13
76
5
20
2
72
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87624096--87624138
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2.2
20
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6
2
55
1.39
87625269--87625317
3
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3
76
19
52
28
2
0
69
1.00
87625273--87625311
11
3.5
11
92
0
69
28
2
0
69
1.02
87625269--87625310
19
2.2
19
87
8
59
26
2
0
71
0.98
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27
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27
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10
191
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22
23
18
1.95
87626545--87626703
54
3.0
54
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2
241
35
22
23
18
1.95
87626808--87626881
28
2.8
26
85
4
85
32
9
21
36
1.86
87628324--87628430
26
4.1
26
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31
1.84
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23
4.7
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14
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17
23
23
36
1.95
87630493--87630595
48
2.1
49
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5
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18
25
22
33
1.96
87643780--87643825
23
2.0
23
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12
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45
10
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23
2.0
23
82
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13
8
37
1.76
87651784--87651836
26
2.0
26
82
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63
24
13
20
41
1.88
87653323--87653430
26
4.2
26
93
0
189
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1.83
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124
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28
1.68
87663307--87663395
44
2.0
44
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4
126
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19
20
1.94
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0
0
59
0.97
87664278--87664319
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2.0
21
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40
0
0
59
0.97
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55
40
0
0
59
0.97
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20
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25
5
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65
1.31
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2.2
23
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0
0
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1.9
32
96
0
113
27
21
11
39
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87669506--87669545
18
2.2
18
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0
53
50
2
5
42
1.37
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12
2.2
12
100
0
54
33
14
7
44
1.73
87670640--87670684
21
2.1
21
95
0
81
60
6
8
24
1.51
87675123--87675162
13
3.0
13
92
3
62
37
10
12
40
1.77
87675336--87675374
19
2.1
19
90
0
60
53
0
0
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1.00
87675375--87675434
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2.8
22
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0
0
48
1.00
87679888--87679936
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2
2
44
1.24
87679903--87679999
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4
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1.40
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51
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1.18
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1.96
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1.94
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2
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120
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1.94
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2
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2
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18
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31
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2
153
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6
19
59
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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59
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2.0
326
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0
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48
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43
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26
1.98
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87
2.7
86
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343
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29
18
26
1.98
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2.0
130
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344
25
30
18
26
1.98
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26
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87725138--87725266
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134
29
4
0
65
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
25
0
72
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
200
27
22
22
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427