Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  415  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120696586--120696618
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12
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0
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0
0
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0
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24
1.95
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2.7
84
87
7
300
37
15
24
22
1.93
120700695--120700938
127
1.9
127
91
0
398
37
13
25
23
1.92
120700812--120700995
46
4.0
46
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41
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25
0
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1.52
120708471--120708511
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
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1.53
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1.63
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2.2
22
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60
4
16
18
1.51
120715122--120715161
20
1.9
22
90
10
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27
0
5
67
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.4
23
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6
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1
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89
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15
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18
88
0
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39
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120766505--120766566
18
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1.83
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2.0
66
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0
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31
13
13
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18
2.4
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42
1
2
53
1.24
120801987--120802054
20
3.3
20
70
13
59
51
2
1
44
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120802086--120802119
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16
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0
0
50
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1.9
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1
40
1.27
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29
2.5
29
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51
14
12
21
1.75
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13
4.9
13
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1.77
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2.6
23
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13
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12
100
0
64
31
15
0
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1.43
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0
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0
62
1.16
120823461--120823570
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31
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1.14
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1.91
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6
6.7
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1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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103
53
2
2
41
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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