Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  294  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85006460--85006498
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2.0
19
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2
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0
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0
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0
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1.05
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70
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1.09
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2.5
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2.2
33
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0
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21
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2.2
29
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60
0
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36
1.12
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20
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1.15
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0
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3.3
51
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21
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96
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27
20
19
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1.97
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1.9
143
81
7
328
27
21
18
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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9
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28
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29
1.94
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65
1.9
65
86
0
176
49
9
19
21
1.77
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49
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9
200
30
29
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23
1.97
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7.7
7
80
10
63
0
13
0
86
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13
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14
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2.9
29
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29
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0
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32
14
26
1.95
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16
90
0
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28
14
32
25
1.94
85058833--85058886
27
2.1
25
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63
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18
16
1.89
85058895--85058925
15
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0
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0
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113
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2.2
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100
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0
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22
17
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0
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0
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325
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4.6
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297
23
22
27
27
1.99
85097778--85097954
40
4.5
40
87
3
234
25
27
23
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85097778--85097951
79
2.2
79
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2
251
25
27
22
24
2.00
85098865--85099392
27
19.6
27
85
2
641
28
21
9
40
1.84
85106221--85106282
24
2.4
26
81
10
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70
1
17
9
1.22
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29
2.6
29
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25
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1.9
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0
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1.94
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1.97
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48
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11
202
24
28
18
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1.98
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19
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56
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0
5
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0
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25
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1.83
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18
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10
100
35
27
14
22
1.93
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28
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2
73
23
33
16
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.98
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1.98
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0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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