Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  95  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25151624--25151803
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25
26
23
25
2.00
25153910--25153962
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1.34
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0
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79
0
15
4
0.90
25158685--25158736
8
6.6
8
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12
54
80
0
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3
0.85
25158706--25158742
8
4.3
9
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6
51
78
0
18
2
0.87
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82
2.4
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17
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12
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25161006--25161175
35
4.8
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243
38
12
12
35
1.81
25161006--25161175
52
3.2
52
89
5
243
38
12
12
35
1.81
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4.1
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32
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16
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2.4
27
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14
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27
21
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1.99
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13
2.1
13
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26
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18
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2.0
33
100
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17
17
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20
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0
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1.30
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29
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27
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5
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29
32
16
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
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26
28
29
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1.96
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21
2.3
21
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0
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25
1.91
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93
2.1
97
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28
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19
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25202280--25202312
17
2.0
17
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26
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25
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2.0
72
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100
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20
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0
0
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15
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51
6
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0
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18
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2.1
50
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2.0
49
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20
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32
23
0
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1.54
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29
25
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43
1.62
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20
3.5
20
86
0
88
25
25
0
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1.51
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13
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1.85
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26
2.5
26
76
2
85
33
27
7
30
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25248932--25248957
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100
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0
0
50
1.00
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18
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0
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46
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24
18
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1.98
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27
4.3
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142
34
19
25
20
1.96
25259888--25260000
55
2.1
54
88
6
167
33
19
25
21
1.97
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2.3
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26
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0
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0
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1
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1.09
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30
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1.31
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0
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0
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63
0
0
36
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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58
10
0
31
1.31
25290976--25291065
38
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39
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10
0
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1.32
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12
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12
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9
0
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1.27
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21
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0
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137
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9
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1
24
0
74
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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52
2
13
30
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.97
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20
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22
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2.0
28
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18
22
41
17
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427