Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  34  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.49
Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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8699725--8699843
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49
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2.0
39
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120
44
16
15
23
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Indels
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A
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Entropy
(0-2)
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76
0.99
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3
15.7
3
100
0
94
34
0
0
65
0.93
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17
2.0
17
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0
50
5
35
0
58
1.22
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11
3.4
11
84
0
56
56
0
0
43
0.99
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2.2
27
77
11
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62
6
8
22
1.47
8815737--8815773
7
5.3
7
93
0
65
59
0
0
40
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93
3.1
93
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379
22
12
17
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8823747--8823786
19
2.0
21
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2
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1.27
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24
79
7
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46
5
0
48
1.24
8824296--8824345
23
2.2
23
85
7
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48
6
0
46
1.27
8824328--8824377
21
2.5
20
86
3
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40
0
4
56
1.18
8824343--8824467
59
2.2
58
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5
148
45
0
4
49
1.23
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26
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23
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50
0
5
44
1.25
8824420--8824448
11
2.7
11
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55
0
0
44
0.99
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2.1
34
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10
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48
0
4
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8824383--8824457
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12
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49
0
5
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1.25
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59
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3
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1.9
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0
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1.22
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2.0
21
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31
0
2
65
1.05
8827454--8827594
27
5.3
26
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183
35
23
24
17
1.95
8827454--8827592
53
2.6
55
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3
203
35
23
24
17
1.95
8829151--8829254
25
4.2
24
92
7
172
37
25
4
32
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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14
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32
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2
17
1.61
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27
5.2
28
90
5
184
35
22
24
17
1.96
8833914--8833960
20
2.3
21
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19
0
8
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1.10
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26
2.4
24
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28
0
3
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1.82
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7
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0
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2.0
23
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1.62
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27
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26
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23
1.96
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2.0
26
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1.97
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27
7.4
27
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0
283
24
20
20
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1.96
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27
2.3
26
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2
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36
20
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21
1.95
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33
2.0
32
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20
1.96
8870294--8870347
27
2.0
27
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92
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22
1.98
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27
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26
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19
24
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1.98
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27
6.4
27
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2
222
25
20
18
35
1.95
8870348--8870519
54
3.2
54
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3
249
25
20
18
35
1.95
8870348--8870519
80
2.1
81
87
4
249
25
20
18
35
1.95
8871627--8871662
17
2.1
17
89
0
54
16
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2
72
1.21
8871597--8871824
89
2.5
91
86
7
333
25
14
19
40
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8871718--8871751
16
2.1
16
94
0
59
20
8
0
70
1.13
8871734--8871897
73
2.2
73
89
0
247
26
14
20
39
1.90
8871880--8871914
14
2.5
14
85
0
52
22
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2
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1.34
8871820--8871983
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1.9
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2
285
26
15
20
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1.92
8871987--8872276
85
3.4
81
79
10
278
26
17
20
35
1.94
8873681--8873718
17
2.4
17
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0
2
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0
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23
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1.48
8879632--8879687
14
4.1
13
75
24
53
60
1
1
35
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427