Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  55  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13359472--13359509
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26
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0
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257
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1.94
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6.5
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91
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28
18
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4.1
7
100
0
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44
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13
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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T
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15
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2.2
23
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2.4
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11
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101
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2
0
46
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13466452--13466573
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26
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2.2
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18
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19
19
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65
1.13
Indices
Period
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Copy
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Indels
Score
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0
59
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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105
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0
10
22
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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18
7
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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