Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  270  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
101
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18
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17
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20
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20
14
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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28
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5.2
40
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211
25
22
25
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
16
19
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1.94
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133
3.3
132
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1.95
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15
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1.94
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2.6
227
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33
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1.94
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1.8
183
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180
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196
28
14
33
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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2
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14
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32
1.94
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30
2.0
30
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0
86
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8
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29
1.84
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26
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26
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4
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34
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22
1.94
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78
2.7
78
78
2
225
35
28
14
21
1.93
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52
2.8
52
87
0
196
34
28
14
22
1.94
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5
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32
25
13
28
1.93
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11
197
24
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27
1.99
77992872--77993088
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28
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1.99
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1.99
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1.95
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52
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1.93
78010093--78010310
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1.94
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23
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1.94
78012644--78012758
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54
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23
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1.94
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0
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1.94
78018440--78018553
54
2.1
53
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23
22
16
1.94
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1.8
93
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0
317
27
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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20
21
1.98
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21
1.98
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1.98
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20
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1.95
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0
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1.95
78087355--78087508
29
5.5
28
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6
145
31
25
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78087355--78087458
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0
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0
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0
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1.82
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1.84
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4.7
27
79
3
123
27
8
23
40
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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