Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  17  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.80
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14
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36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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19
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105
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2.0
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11
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1.8
93
96
0
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29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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0
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8
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58
2
0
38
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4868986--4869034
24
2.1
23
84
3
62
51
8
2
38
1.43
4871805--4871863
30
2.0
30
86
0
82
13
35
8
42
1.75
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24
2.1
24
82
3
59
55
5
3
34
1.42
4872693--4872744
24
2.2
24
86
3
70
53
5
1
38
1.36
4880841--4880888
21
2.5
21
83
12
59
18
20
41
18
1.90
4884969--4885010
2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
4886647--4886712
2
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2
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3
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3
4
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1.38
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132
3.4
131
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2
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28
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28
27
1.96
4902676--4903194
132
4.0
130
75
9
426
29
18
17
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1.94
4903751--4903792
20
2.1
20
100
0
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4
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1.45
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19
4.4
17
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17
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7
1
28
1.29
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26
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26
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0
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33
5
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36
1.78
4910855--4911140
136
2.1
137
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0
511
24
18
24
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1.97
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17
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16
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0
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0
9
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1.35
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24
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3
1
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1.20
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12
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57
0
6
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1.23
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25
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25
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0
7
33
1.25
4914350--4914420
26
2.7
25
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18
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57
2
2
36
1.28
4926047--4926215
83
2.0
83
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2
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20
28
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37
1.90
4929541--4929724
43
4.3
43
82
1
217
30
29
15
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
42
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2
165
30
25
18
25
1.98
4929532--4929724
85
2.3
86
84
1
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31
27
15
24
1.96
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2.2
17
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8
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2
0
75
0.93
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7
14.0
7
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0
1
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0
0
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2.0
55
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0
2
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1.05
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0
2
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1.06
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3
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1.67
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3.5
15
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5
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47
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1
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1.62
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41
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22
25
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1.98
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3.0
157
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15
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1.93
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0
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0
0
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25
0
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1.52
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19
2.5
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2
0
31
1.04
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0
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1.01
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30
2.3
30
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0
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10
5
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1.55
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32
2.3
32
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33
4
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41
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15
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16
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70
2
0
27
0.98
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11
6.5
11
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2
1
29
1.15
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40
2.0
40
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0
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1.70
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2
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2
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0
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0
2
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12
2.8
12
82
17
50
36
0
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4975829--4975860
16
2.1
15
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55
34
0
0
65
0.93
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21
5.6
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17
70
36
3
0
59
1.21
4975836--4975944
7
15.4
7
69
19
50
36
3
0
58
1.22
4977832--4977903
30
2.3
31
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78
44
12
13
29
1.81
4987050--4987093
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2.8
15
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2
4
34
1.30
4987056--4987099
17
2.5
19
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54
2
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36
1.40
4987156--4987200
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2.1
21
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8
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19
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19
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1
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1.28
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2.9
27
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3
5
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1.36
4987313--4987346
16
2.1
17
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5
61
67
2
0
29
1.05

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427