Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  162  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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556
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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(0-2)
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0
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2.0
20
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21
14
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2.00
45054663--45054814
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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G
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(0-2)
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23
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92
5
263
19
28
17
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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71
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0
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17
35
1.94
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71
2.8
70
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3
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20
28
17
33
1.95
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2.1
31
90
0
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23
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24
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5
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22
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28
1.99
45175871--45175989
47
2.5
48
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5
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27
22
21
28
1.99
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20
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1.84
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1.84
45177429--45178009
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1.84
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2.00
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1.99
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2.1
13
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0
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7
40
14
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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19
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1.96
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1.98
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15
16
11
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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1.65
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1.62
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1.67
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20
1.98
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1.99
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4.2
29
84
3
145
23
15
32
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427