Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  322  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93829215--93829298
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3.2
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0
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3.0
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20
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28
28
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2
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0
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3
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2.8
28
80
0
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16
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2.0
69
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2
175
42
16
15
26
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93872388--93872534
24
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22
75
9
80
42
16
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1.86
93872395--93872540
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3.1
47
81
6
170
40
15
17
26
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
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1.9
57
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18
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16
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88
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28
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222
4.2
222
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1.96
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6.2
132
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15
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5.2
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2.0
45
100
0
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21
1.67
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4.2
26
91
0
175
33
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24
35
1.81
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2.1
25
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70
30
0
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1.48
93920517--93920566
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2.1
25
85
7
68
30
0
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25
22
25
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93923569--93923774
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247
25
26
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25
2.00
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25
19
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1.99
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42
2.7
43
79
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148
29
25
18
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93943550--93943709
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85
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25
1.98
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3.7
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190
22
20
27
30
1.98
93947070--93947240
93
1.8
93
92
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20
28
29
1.98
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2.0
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42
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38
1.68
93948657--93948742
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2.4
36
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93
39
16
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36
1.78
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2.2
18
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51
50
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0
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29
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1.98
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20
2.5
20
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0
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3
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Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
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Indels
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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17
27
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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