Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  11  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2210009--2210061
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31
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4
99
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1
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1.09
2210936--2211009
15
4.9
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12
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1.71
2211029--2211501
180
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595
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2.0
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1
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0
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0
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0
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0
0
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2244430--2244474
16
2.8
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26
0
0
73
0.84
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53
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2.0
21
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9
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15
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16
1
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1.05
2262335--2262400
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2.3
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38
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3.0
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26
1.90
2262908--2263220
48
6.3
49
83
7
330
40
21
11
26
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2262908--2263220
98
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97
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40
21
11
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1.87
2263997--2264041
19
2.4
19
88
0
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2
2
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2263997--2264040
10
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9
5.4
9
88
9
66
12
2
2
84
0.80
2275991--2276039
17
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12
64
12
2
2
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12
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82
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0
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0
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20
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34
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1.08
2297339--2297396
18
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16
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20
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36
1
1
60
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43
2.1
43
93
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151
42
26
8
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1.82
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29
2.6
29
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100
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1
51
1.17
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23
2.4
23
87
6
76
45
1
1
50
1.22
2321189--2321271
29
2.9
28
87
5
103
61
1
1
36
1.12
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23
2.4
23
84
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67
40
5
0
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1.23
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30
2.3
29
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102
39
2
1
56
1.23
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17
3.8
17
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8
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1
3
52
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2
16.5
2
93
6
57
50
0
50
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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34
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1.00
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1
0
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2.2
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1
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60
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22
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0
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0
50
1.20
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17
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0
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1.19
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24
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100
0
74
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51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2379036--2379078
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0
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2
93
6
55
48
0
0
51
1.00
2399704--2399775
20
3.8
19
73
10
58
51
1
0
47
1.09
2402527--2402609
26
3.2
24
72
20
69
46
2
3
46
1.33
2402509--2402616
53
2.1
53
85
1
146
43
2
3
50
1.34
2402616--2402649
14
2.5
14
85
4
52
50
0
0
50
1.00
2409366--2409404
2
19.5
2
100
0
78
51
0
48
0
1.00
2416295--2416356
27
2.3
27
85
0
79
14
45
16
24
1.84
2417480--2417510
3
10.3
3
100
0
62
67
0
0
32
0.91
2417824--2417878
21
2.6
22
86
11
71
40
0
1
58
1.09
2417903--2417968
26
2.6
26
85
7
91
57
0
0
42
0.98
2418067--2418114
18
2.6
18
76
6
51
50
6
0
43
1.27
2429479--2429702
123
1.8
122
87
2
333
32
12
16
38
1.87
2429474--2429730
123
2.1
122
83
3
329
28
13
19
38
1.89
2436739--2436811
36
2.1
36
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2
112
53
0
2
43
1.15
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18
2.0
18
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63
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0
47
1.50
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14
2.1
14
100
0
58
20
13
13
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1.75
2446515--2446544
1
30.0
1
100
0
60
100
0
0
0
0.00
2449262--2449324
17
3.5
17
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10
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42
1
3
52
1.27
2449282--2449331
17
2.9
16
80
14
55
50
2
0
48
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2449310--2449438
29
4.4
29
72
13
104
54
3
3
39
1.32
2452505--2452532
14
2.0
14
100
0
56
35
0
7
57
1.26
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20
1.9
20
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10
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31
2
21
44
1.66
2457926--2457963
9
4.3
9
96
3
69
65
0
0
34
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16
2.0
16
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2
2
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1.22
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16
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16
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3
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9
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10
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67
0
0
32
0.91
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26
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0
0
31
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16
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16
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0
51
66
0
0
33
0.92
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20
2.3
19
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13
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0
4
51
1.21
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13
2.2
13
100
0
56
25
7
32
35
1.83
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12
3.0
13
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35
0
0
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11
3.2
11
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52
33
0
0
66
0.92
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12
2.8
12
90
0
50
5
5
8
79
1.05
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20
2.3
22
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43
4
2
50
1.33
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24
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26
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20
65
55
0
1
43
1.10
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14
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14
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54
5
0
40
1.24
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49
2.0
51
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4
139
56
1
0
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1.06
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24
3.1
24
78
5
71
50
5
0
44
1.24
2500415--2500464
24
2.1
23
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10
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46
4
8
42
1.52
2501756--2501810
18
3.1
18
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15
51
36
0
0
63
0.95
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21
2.6
21
83
11
69
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2501847--2501917
27
2.7
26
76
6
70
52
2
0
45
1.15
2508479--2508503
13
1.9
13
100
0
50
40
0
8
52
1.31
2508535--2508597
29
2.2
28
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5
74
46
1
0
52
1.10
2508591--2508624
14
2.3
15
90
5
52
47
2
0
50
1.16
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2.0
21
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4
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36
2
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1.54
2517752--2517793
21
2.0
21
90
0
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28
0
7
64
1.20
2517757--2517804
21
2.3
21
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0
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2
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2.0
15
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1.66
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25
2.0
24
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7
73
42
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1.70
2544913--2544958
20
2.3
20
96
0
83
50
4
4
41
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402