Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  39  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.42
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2.3
26
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192
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4.6
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2.6
41
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1
124
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26
18
17
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.45
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7
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0
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1
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20
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2.2
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1.80
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12
30
1.83
7882660--7882741
32
2.6
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2.1
27
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87
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12
16
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28
2.5
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93
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14
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26
2.0
27
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70
11
13
17
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2.2
25
89
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31
5
3
59
1.38
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27
2.8
26
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15
87
13
9
4
72
1.24
7894042--7894097
16
3.4
16
79
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60
17
7
0
75
1.03
7896298--7896357
14
4.2
14
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3
1
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1.07
7896288--7896349
20
3.0
20
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4
52
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1
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22
2.1
22
92
0
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44
12
10
31
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9.7
19
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11
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1.75
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3.4
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10
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1.73
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44
16
5
33
1.72
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22
3.3
21
72
20
71
44
14
6
34
1.72
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5.5
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213
43
15
8
33
1.76
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21
9.3
23
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11
137
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12
5
37
1.65
7898455--7898718
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11.8
22
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5
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1.61
7906119--7906154
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12
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0
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129
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0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7945523--7945556
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5
96
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51
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0
0
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3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
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25
2.2
25
81
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16
3
7
73
1.20
7957374--7957431
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19
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0
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0
0
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2
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14
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1.19
7958038--7958092
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20
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14
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7972137--7972175
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0
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3
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0
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0
0
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0.89
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
Entropy
(0-2)
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24
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39
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0
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30
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7.7
23
71
16
96
25
5
1
67
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8010950--8011057
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23
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402