Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  33  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6934800--6934863
24
2.7
24
88
7
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35
3
7
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1.46
6934970--6935083
18
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19
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13
105
35
3
10
50
1.54
6934970--6935083
55
2.1
55
95
3
203
35
3
10
50
1.54
6934970--6935083
20
6.2
18
71
20
69
35
3
10
50
1.54
6938327--6938361
16
2.1
16
89
5
52
25
2
5
65
1.28
6940958--6940988
16
1.9
16
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0
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1.80
6941670--6941694
13
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100
0
50
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12
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6943822--6943920
22
4.6
22
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7
78
46
6
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1.62
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11
5.1
11
77
0
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55
7
3
33
1.45
6944075--6944130
22
2.5
22
80
5
69
55
7
3
33
1.45
6944155--6944209
22
2.5
22
88
5
76
52
5
10
30
1.59
6944403--6944473
22
3.2
21
82
11
72
60
2
5
30
1.34
6944251--6944495
22
11.2
21
68
12
66
50
4
9
34
1.57
6944768--6944931
53
3.1
54
75
15
139
50
2
1
45
1.25
6944903--6945123
11
20.0
11
63
24
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49
1
1
47
1.18
6944978--6945089
21
5.8
20
70
20
78
44
1
0
53
1.11
6944981--6945501
53
9.4
56
69
20
188
47
1
0
49
1.17
6945095--6945123
13
2.1
14
93
6
51
58
0
0
41
0.98
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11
4.0
13
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15
50
45
0
2
52
1.12
6945254--6945378
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1.9
63
84
7
162
49
0
1
48
1.16
6944766--6945514
18
37.2
20
65
23
158
48
2
1
48
1.22
6945213--6945465
108
2.4
107
80
12
258
47
1
1
49
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6945395--6945468
19
4.1
18
77
8
71
47
1
0
51
1.09
6945412--6945501
31
3.0
30
77
14
96
52
1
0
46
1.07
6945254--6945501
108
2.4
100
76
11
232
48
1
1
48
1.18
6945423--6945487
13
4.7
14
73
21
57
53
1
0
44
1.09
6945191--6945347
28
5.1
31
67
18
62
49
1
0
48
1.17
6945633--6945657
11
2.3
11
100
0
50
84
8
0
8
0.79
6945837--6945893
22
2.6
21
83
10
62
50
3
5
40
1.42
6945748--6945884
22
6.2
22
75
2
105
48
5
4
41
1.47
6946251--6946307
30
1.9
30
85
7
80
47
5
5
42
1.48
6946276--6946349
22
3.4
21
70
7
58
45
9
4
40
1.55
6946346--6946389
22
2.0
22
90
0
70
47
6
6
38
1.57
6946276--6946371
44
2.2
44
83
3
113
45
8
5
40
1.56
6946391--6946456
22
3.0
22
84
4
89
48
4
6
40
1.48
6946833--6946956
21
5.8
21
75
2
86
46
12
7
33
1.69
6952885--6952926
15
2.9
15
80
16
52
4
14
4
76
1.12
6952890--6952927
15
2.6
15
84
15
53
5
15
2
76
1.08
6954733--6954799
14
5.1
13
79
15
75
23
4
0
71
1.04
6956417--6956607
50
3.9
50
82
7
194
39
16
12
31
1.86
6956484--6956620
49
2.8
49
89
2
202
41
16
12
29
1.85
6956483--6956722
49
4.8
49
76
14
195
42
16
12
29
1.84
6956529--6956752
100
2.2
101
79
10
235
41
16
12
29
1.85
6957554--6957600
10
4.8
10
84
5
60
4
10
0
85
0.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6975071--6975211
70
2.0
70
97
0
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31
16
19
33
1.94
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22
2.0
22
90
0
68
60
2
0
37
1.10
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20
2.0
21
90
4
68
57
0
0
42
0.99
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20
3.0
20
79
9
72
50
3
0
46
1.17
6981043--6981134
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2.8
33
80
9
123
47
3
1
47
1.25
6995848--6995910
32
2.0
32
93
0
108
34
14
17
33
1.90
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24
2.0
26
84
11
68
28
2
6
63
1.30
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2.5
13
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9
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54
15
6
24
1.63
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10
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11
90
9
55
64
0
0
35
0.94
6999769--6999817
24
2.0
24
88
0
71
63
2
2
32
1.17
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119
6.1
118
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14
20
19
1.84
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2.2
237
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6
639
47
14
19
18
1.82
7000243--7000894
352
1.8
353
84
5
886
46
14
19
19
1.84
7026216--7026390
73
2.4
74
79
3
201
33
5
6
54
1.49
7026913--7026957
18
2.4
18
79
13
56
20
2
4
73
1.11
7026915--7026959
19
2.4
19
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7
56
20
2
4
73
1.11
7027564--7027651
27
3.2
26
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30
67
37
13
6
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1.71
7027563--7027774
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3.7
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36
11
7
44
1.68
7027563--7027788
59
3.9
58
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10
275
36
11
7
45
1.67
7027802--7027851
11
4.7
10
80
11
55
82
0
2
16
0.77
7027802--7027870
5
12.8
5
79
14
59
78
0
4
17
0.91
7027793--7027870
6
13.7
6
72
20
60
78
0
5
16
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7027791--7027870
27
3.0
27
78
10
92
78
0
5
16
0.91
7027886--7027921
3
12.3
3
88
5
56
63
0
2
33
1.08
7028779--7028847
27
2.4
27
85
11
84
69
0
7
23
1.13
7028759--7028866
17
6.2
17
71
14
69
66
0
6
25
1.21
7029086--7029123
5
8.0
5
88
8
53
0
0
13
86
0.56
7029061--7029245
92
2.0
93
92
2
309
22
14
10
53
1.70
7029236--7029507
42
6.4
42
87
3
316
36
20
18
25
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7029236--7029658
41
10.1
41
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8
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37
19
16
26
1.93
7029236--7029658
83
5.1
82
80
9
349
37
19
16
26
1.93
7029236--7029507
125
2.1
131
84
6
353
36
20
18
25
1.95
7031345--7031373
8
3.6
8
100
0
58
10
10
0
79
0.94
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22
2.2
23
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13
59
22
16
2
60
1.46
7035292--7035316
11
2.3
11
100
0
50
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0
8
8
0.79
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12
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12
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84
0
10
5
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3.2
27
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36
16
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1.75
7035350--7035614
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10
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35
15
7
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1.75
7035350--7035641
120
2.5
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7
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1.72
7035644--7035727
5
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11
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0
4
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6
15.5
6
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17
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0
4
15
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7035637--7035727
17
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16
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80
0
4
15
0.87
7035642--7035727
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4.1
21
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80
0
4
15
0.87
7035633--7035730
15
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16
73
18
84
79
0
6
14
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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10
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70
1
6
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1.19
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24
5.2
24
72
14
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69
0
5
24
1.15
7036661--7036702
15
2.7
15
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3
57
71
0
4
23
1.05
7036651--7036741
28
3.4
25
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11
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70
0
3
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1.03
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2.2
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10
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44
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230
43
16
13
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1.84
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16
3.1
16
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0
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1.74
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1.9
32
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0
86
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21
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41
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35
1.73
7052062--7052281
43
5.1
43
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41
16
5
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1.73
7052065--7052266
107
1.9
107
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0
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16
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0
53
0
3
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0.66
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12
3.1
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100
0
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10
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2.0
50
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137
24
12
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4
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0
53
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0
19
0.90
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2.2
16
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0
54
0
27
2
69
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7058310--7058351
18
2.3
18
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0
66
85
0
0
14
0.59
7058317--7058351
11
3.2
11
95
0
61
88
0
0
11
0.51
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44
2.0
44
95
0
158
47
6
18
27
1.73
7060133--7060184
21
2.5
20
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20
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53
1.57
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25
2.0
25
100
0
100
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40
1.73
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50
1.9
50
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0
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1.91
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0
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0
0
8
0.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402