Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  35  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7223400--7223429
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6
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0
0
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0
0
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2.7
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0
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0
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1.00
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2.1
22
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0
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47
0
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1.28
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2.0
153
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0
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1.78
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17
2.5
17
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22
2
2
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0
0
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0
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18
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1.9
159
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0
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1.87
7230077--7230111
13
2.8
13
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4
54
11
11
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1.47
7233876--7233905
15
1.9
16
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53
20
0
20
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5
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22
76
20
6
2
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1.23
7246250--7246345
21
4.7
20
74
13
81
20
7
1
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1.17
7250776--7250819
20
2.2
18
84
15
52
6
0
13
79
0.92
7250898--7250969
37
2.0
37
83
2
92
58
12
13
15
1.64
7250987--7251029
22
2.0
21
86
4
59
20
16
25
37
1.93
7251293--7251386
34
2.8
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12
95
31
13
19
35
1.91
7251308--7251463
66
2.4
66
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7
183
30
13
21
33
1.92
7251249--7251501
98
2.5
97
80
11
264
30
12
20
36
1.90
7251342--7251864
32
15.8
32
70
9
233
29
14
19
36
1.91
7251417--7251800
102
3.8
98
78
8
281
30
13
18
36
1.90
7251342--7251853
67
7.7
64
71
11
246
29
14
19
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7252105--7252168
22
2.9
22
73
0
65
31
23
15
29
1.95
7252165--7252239
32
2.4
31
82
6
80
32
17
20
30
1.95
7252322--7252383
32
1.9
32
87
6
90
32
12
20
33
1.91
7254504--7254561
29
2.1
27
84
12
73
10
12
5
72
1.26
7255129--7255166
18
2.1
18
95
0
67
21
15
13
50
1.78
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161
7.9
160
80
3
1217
41
15
10
32
1.81
7258784--7260034
323
3.9
321
80
5
1347
41
15
10
32
1.81
7263362--7263407
21
2.2
21
84
0
56
36
19
10
32
1.87
7263368--7263410
21
2.0
21
90
0
68
37
18
11
32
1.87
7270541--7271030
144
3.4
141
79
6
507
42
11
13
33
1.80
7270541--7271098
144
3.9
142
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6
460
41
11
13
33
1.80
7270541--7271071
290
1.8
289
81
3
663
42
11
13
32
1.80
7272893--7272945
16
3.3
15
87
10
70
49
3
0
47
1.19
7273120--7273149
11
2.7
11
100
0
60
26
0
6
66
1.16
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15
2.1
15
94
0
55
46
3
0
50
1.17
7273205--7273244
18
2.2
19
95
4
73
45
0
5
50
1.23
7273198--7273260
24
2.6
25
85
7
76
44
0
9
46
1.36
7273212--7273260
25
2.0
24
88
4
71
42
0
8
48
1.32
7278007--7278053
22
2.2
22
96
3
87
63
8
4
23
1.40
7283308--7283341
16
2.2
16
89
5
52
64
0
0
35
0.94
7283396--7283453
19
3.1
19
90
2
91
44
3
0
51
1.18
7284711--7284742
2
16.0
2
93
0
55
46
0
3
50
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7285198--7285236
20
2.0
20
89
0
60
58
2
7
30
1.39
7285693--7285734
20
2.1
20
82
8
50
47
7
2
42
1.43
7285988--7286030
23
2.0
21
86
9
59
62
2
2
32
1.20
7287701--7288140
120
3.6
120
78
8
309
43
8
7
40
1.63
7287433--7288181
243
3.1
241
75
7
562
41
10
8
39
1.70
7289980--7290110
59
2.3
57
82
7
158
38
12
6
41
1.70
7290043--7290165
66
1.9
65
81
6
151
36
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5
46
1.64
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15
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0
1
13
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3.2
21
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12
77
85
0
1
13
0.67
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19
2.4
19
85
0
56
45
13
19
21
1.84
7290713--7290789
31
2.4
32
84
4
111
44
14
16
24
1.85
7291126--7291285
39
4.1
38
77
12
139
62
0
6
30
1.24
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17
8.1
17
70
21
93
64
0
5
29
1.21
7291114--7291321
4
51.8
4
67
16
69
65
1
5
27
1.22
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50
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49
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13
145
66
1
4
26
1.21
7291125--7291326
7
28.3
7
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18
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65
1
5
27
1.23
7291268--7291338
31
2.4
28
88
9
97
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2
1
18
0.97
7291271--7291338
5
13.6
5
78
21
56
77
2
1
17
0.96
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6.5
11
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11
89
11
5
0
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0.81
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14
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14
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4
51
12
3
0
83
0.77
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11
7.6
12
82
13
109
13
7
1
78
1.01
7303171--7303498
58
5.7
57
88
5
441
36
14
6
42
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7303286--7303376
27
3.2
27
68
24
71
38
15
4
41
1.67
7303515--7303564
5
9.8
5
81
16
59
80
0
4
16
0.87
7303585--7303620
10
3.6
10
88
11
56
66
2
0
30
1.06
7304067--7304136
31
2.2
32
89
2
106
54
15
7
22
1.66
7304461--7304628
25
6.9
25
73
15
113
61
1
5
30
1.27
7304509--7304669
3
49.7
3
70
21
71
66
1
4
27
1.21
7304461--7304561
48
2.2
46
84
8
132
62
0
5
31
1.19
7304501--7304610
10
10.9
10
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21
63
60
1
6
30
1.32
7304589--7304665
4
18.5
4
71
21
52
72
1
3
22
1.08
7304609--7304665
26
2.3
24
84
6
78
77
1
1
19
0.95
7305463--7305505
23
1.9
22
85
4
59
18
2
2
76
1.00
7306111--7306173
31
2.0
31
84
6
83
57
3
7
31
1.43
7314133--7314161
14
2.1
14
100
0
58
37
0
6
55
1.27
7314136--7314169
14
2.4
14
90
0
50
35
5
5
52
1.50
7315428--7315478
18
2.8
18
81
0
57
58
1
3
35
1.28
7315577--7315688
19
5.3
20
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17
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41
1
0
55
1.16
7315610--7315704
25
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24
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18
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44
1
0
54
1.07
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2.2
21
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0
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2
0
50
1.13
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16
2.2
16
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5
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14
5
5
73
1.21
7318290--7318328
2
19.5
2
100
0
78
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0
48
0
1.00
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100
0
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0
0
33
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58
4.1
57
77
11
239
52
6
6
33
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7322424--7322653
116
2.0
117
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9
265
52
6
6
34
1.54
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3
8.3
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0
50
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0
0
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0.90
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36
3.2
36
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9
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49
13
18
18
1.79
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224
2.0
220
80
5
502
44
13
21
19
1.85
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110
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111
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21
20
1.86
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21
2.4
19
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16
0
30
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1.43
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21
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17
0
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22
0
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38
1.54
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1.9
25
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2
27
27
1.67
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246
4.0
246
99
0
1923
34
5
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1.74
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1.9
16
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0
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0
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1.36
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2.0
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3
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1.68
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349
2.0
350
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0
1133
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7
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1.80
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5
30
1.37
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18
17.0
18
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1
1
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1.15
7371424--7371743
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276
56
1
1
40
1.15
7371429--7371757
104
3.1
105
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279
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1
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26
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25
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49
1
0
49
1.11
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26
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1
0
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2.5
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32
1
1
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1.08
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17
2.8
17
78
9
53
60
2
0
37
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7378996--7379023
2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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0
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0
0
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2.0
21
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23
2
0
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0.94
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20
2.0
20
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50
2
5
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1.39
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4.8
87
80
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381
28
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1.74
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2.0
63
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149
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5
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1.77
7387336--7387934
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36
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1.83
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42
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1.84
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111
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24
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23
1.83
7388967--7388996
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2.3
13
94
0
51
63
13
0
23
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402