Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  38  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7691472--7691567
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10
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2.2
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2.5
20
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0
93
35
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25
31
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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1.24
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3.0
24
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1.38
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2.0
17
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1.69
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30
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27
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1.63
7722825--7722891
23
2.9
23
69
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26
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20
1.64
7722825--7722944
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2.6
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145
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26
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1.67
7722965--7723013
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616
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1989
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6
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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326
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23
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22
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7760011--7760044
9
3.9
9
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61
70
0
20
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1.13
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12
2.6
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14
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0
12
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149
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539
48
8
20
21
1.76
7762271--7762715
150
3.0
145
81
9
538
48
8
20
21
1.76
7763614--7763767
64
2.4
64
82
3
204
39
14
14
31
1.86
7763819--7763896
41
1.9
41
89
0
120
35
20
11
32
1.88
7764212--7764250
11
3.7
10
87
12
60
87
0
12
0
0.55
7765770--7765941
80
2.2
80
85
3
240
32
16
18
33
1.93
7765774--7765973
80
2.5
80
83
4
219
33
16
18
32
1.93
7766277--7766332
27
2.1
26
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3
67
83
7
1
7
0.86
7766672--7766717
9
5.2
9
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10
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17
2
4
76
1.06
7768364--7768390
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
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16
3.4
17
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57
0
1
40
1.09
7772915--7772947
17
1.9
17
88
11
50
3
9
3
84
0.82
7774416--7774448
2
17.0
2
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6
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51
0
0
48
1.00
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19
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0
0
16
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1.9
25
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0
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0
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1.25
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25
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26
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15
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4
0
58
1.19
7775160--7775239
29
2.6
30
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5
81
38
3
0
57
1.17
7782374--7782418
23
2.0
23
100
0
90
28
13
4
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1.59
7782699--7782776
28
2.7
29
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9
70
43
0
5
51
1.24
7783659--7783719
18
3.4
17
73
20
52
34
1
3
60
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
2.5
20
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13
62
32
0
2
65
1.05
7783660--7783705
19
2.5
18
83
13
58
32
0
2
65
1.05
7786835--7786861
14
1.9
14
100
0
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7
0
14
0.97
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10
4.0
10
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3
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0
15
0
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7786984--7787022
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2.0
20
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0
15
0
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0
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3
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2.5
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0
28
2
1.01
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0
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0
0
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6.1
50
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30
9
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1.81
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13
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0
50
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1.70
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2
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2.1
86
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213
38
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1.83
7806832--7807006
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4.1
43
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187
40
18
8
33
1.81
7807912--7807951
19
2.1
19
100
0
80
42
25
5
27
1.75
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59
2.3
59
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7
202
22
3
19
54
1.59
7812213--7812260
18
2.6
19
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6
82
33
6
33
27
1.82
7812672--7812707
11
3.3
11
92
0
63
25
0
30
44
1.54
7812699--7812730
12
2.4
14
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10
50
25
0
21
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1.46
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20
2.7
20
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0
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32
1
7
58
1.37
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34
2.0
34
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2
111
62
13
4
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1.47
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22
2.2
24
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9
3
28
1.48
7818783--7818812
7
4.3
7
91
0
51
90
10
0
0
0.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7821228--7821305
41
1.9
41
94
0
138
32
23
10
34
1.88
7823732--7823764
17
1.9
18
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11
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48
3
6
42
1.43
7824854--7824886
3
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3
100
0
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33
0
0
66
0.92
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11
3.3
11
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26
0
0
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0.83
7833033--7833396
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3.6
100
81
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365
40
9
6
43
1.64
7834396--7834434
14
2.9
14
88
3
53
10
20
25
43
1.83
7842726--7842976
97
2.5
101
81
3
303
38
8
7
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1.62
7843118--7843161
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10.0
4
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4
0
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1.06
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1
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2.0
82
91
0
265
43
20
10
24
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402