Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  50  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9595940--9596043
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57
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9598621--9598953
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13
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1.71
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8
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12
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9608753--9609384
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12
7
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3.5
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17
66
42
12
2
42
1.57
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59
10.7
59
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710
37
12
6
42
1.71
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13
2.3
13
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1.30
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1.25
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2.3
75
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11
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1.73
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22
3.0
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10
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0
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2.4
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0
0
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2.5
14
85
0
52
71
2
2
22
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2
2
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2.0
41
100
0
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2
2
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13
3.4
14
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8
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1.10
9626740--9626821
42
2.0
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1.60
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14.0
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1.11
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1
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2.1
175
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20
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1.49
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37
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18
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12
60
31
11
9
47
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19
2.2
19
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51
1.14
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18
2.8
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14
1.75
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19
3.1
21
80
10
62
57
14
7
20
1.61
9652245--9652295
7
7.3
7
76
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50
58
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9
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1.61
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2.0
27
82
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2.5
31
86
2
107
28
16
9
46
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
88
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40
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15
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39
0
0
60
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2.0
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41
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0
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93
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0
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26
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2
16
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18
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11
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9
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0
16
5
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9753521--9753585
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16
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19
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43
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5
168
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8
14
38
1.77
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21
5.8
22
87
5
157
37
8
14
38
1.77
9755101--9755302
108
1.8
111
89
3
320
36
13
16
33
1.88
9755578--9755874
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42
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10
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44
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9756993--9757043
8
5.8
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78
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1
15
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2.0
168
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124
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8
5
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1.59
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22
2.4
22
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0
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17
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2
0
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1.13
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17
2.1
18
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27
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1.70
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0
8
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17
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16
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0
6
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2
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1
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22
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0
0
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4
13.2
4
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3
72
72
1
1
24
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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13
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0
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130
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1.05
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0
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0
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0
0
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0
0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0
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0
0
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2.3
64
79
10
175
13
18
11
56
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402