Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  49  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9469479--9469543
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2.0
20
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9470114--9470170
9
6.1
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80
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45
3
0
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1.18
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2.4
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1
4
21
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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2.3
24
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1.37
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26
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1
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60
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2.0
244
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2
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1.80
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2.0
116
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1.50
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2
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120
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1.48
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114
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2.0
107
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15
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0
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2.4
17
92
8
66
4
9
2
82
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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1.27
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1.9
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2.0
21
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10
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2.0
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0
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22
85
12
70
70
6
5
18
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9549035--9549169
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1.79
9549509--9549585
21
3.7
21
82
1
84
35
12
11
40
1.80
9549440--9549745
100
3.0
100
86
3
425
34
16
11
38
1.84
9549656--9549825
79
2.2
79
87
0
250
36
18
10
35
1.84
9549791--9549831
21
2.0
21
90
0
64
41
17
7
34
1.77
9549814--9549923
25
4.6
25
76
8
111
37
9
10
42
1.72
9549839--9549933
46
2.1
46
91
0
154
38
10
11
38
1.76
9550954--9551050
18
5.3
19
73
20
73
3
23
0
73
0.98
9550954--9551047
45
2.1
44
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2
107
3
23
0
73
0.98
9550992--9551059
18
3.7
18
77
13
75
1
20
0
77
0.84
9550998--9551061
20
3.4
19
75
16
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1
20
0
78
0.84
9551042--9551080
13
3.0
13
78
14
53
10
15
0
74
1.07
9551042--9551092
26
2.0
25
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7
59
11
21
0
66
1.23
9555076--9555258
57
3.2
58
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6
228
34
8
8
48
1.64
9555076--9555258
59
3.2
59
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5
214
34
8
8
48
1.64
9556679--9556743
22
3.0
21
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17
80
70
6
3
20
1.22
9563131--9563272
73
2.0
71
88
5
214
40
10
4
45
1.58
9564248--9564336
4
22.0
4
71
11
65
68
1
2
28
1.08
9564226--9564286
27
2.3
27
88
0
95
65
1
3
29
1.18
9564249--9564308
22
2.7
22
87
10
86
66
1
3
28
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9564226--9564311
27
3.4
25
74
22
81
66
2
3
27
1.20
9564214--9564334
24
5.1
24
70
15
67
67
1
3
27
1.15
9564256--9564348
32
2.9
31
75
13
89
68
2
2
26
1.12
9564545--9564699
44
3.5
44
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3
188
39
20
16
23
1.92
9564542--9564736
87
2.2
88
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4
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38
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15
24
1.92
9564553--9564773
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5.1
43
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12
158
41
19
15
24
1.89
9564750--9564841
41
2.2
41
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3
150
39
21
10
28
1.87
9565094--9565134
16
2.5
16
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36
19
19
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1.95
9565799--9565851
27
2.0
27
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7
72
7
5
1
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0.82
9565799--9565852
10
5.8
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82
8
56
7
7
1
83
0.88
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15
2.0
15
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0
51
50
6
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20
1.71
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61
2.7
61
82
1
213
33
12
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48
1.65
9576433--9576570
72
1.9
72
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2
197
37
10
5
46
1.62
9576495--9576637
60
2.4
59
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15
132
37
11
4
46
1.60
9576520--9576652
60
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60
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148
37
12
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1.64
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5.9
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18
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0
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13
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12
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13
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0
0
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0.81
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4
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4
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16
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67
0
1
30
1.02
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24
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100
66
0
1
31
1.02
9577583--9577695
32
3.4
33
79
11
117
67
0
1
30
1.01
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56
2.3
58
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9
171
65
0
2
31
1.05
9577571--9577698
24
5.1
24
74
17
79
65
0
2
32
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9580757--9580866
18
6.3
18
73
10
93
30
3
31
33
1.75
9580827--9580882
18
2.9
18
86
7
58
32
7
35
25
1.83
9581208--9581242
6
5.8
6
89
0
52
34
42
0
22
1.54
9584726--9584772
23
2.0
23
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8
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59
6
0
34
1.23
9588454--9588496
19
2.2
19
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4
59
34
13
2
48
1.56
9588964--9589001
15
2.6
15
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4
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52
7
5
34
1.53
9592784--9592810
2
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2
100
0
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0
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0
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0
0
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26
6
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1.46
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909
3.1
909
88
4
4153
29
9
10
50
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402