Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  32  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6782194--6782271
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29
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0
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0
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3.9
19
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1.01
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2.5
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0
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10
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2.0
20
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0
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20
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3.8
18
88
1
86
21
1
11
65
1.32
6784564--6784638
18
4.2
18
87
1
98
20
1
12
66
1.30
6785677--6785783
20
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136
28
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75
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17
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66
2.9
66
82
3
210
40
12
28
18
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6798009--6798340
65
5.1
66
69
7
174
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14
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13
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1
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1.9
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0
56
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10
2
80
0.98
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0
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6799503--6799545
10
4.2
10
90
3
68
0
11
0
88
0.52
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2.2
20
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0
11
0
88
0.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
222
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26
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17
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0
2
31
1.05
6803480--6803595
6
19.3
6
84
11
114
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0
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1.24
6803606--6803657
19
2.6
20
79
14
63
76
1
5
15
1.05
6804801--6804907
51
2.1
51
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162
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20
2.0
20
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1.66
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4.1
21
71
20
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36
1
11
50
1.46
6807311--6807486
3
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69
15
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35
5
3
55
1.40
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17
3.6
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1
4
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22
3
3
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17
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81
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1.79
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2.5
35
79
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92
36
1
10
52
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2.8
40
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21
102
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4
4
57
1.37
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3
48.7
3
70
17
54
34
4
4
55
1.42
6818951--6818981
16
2.0
15
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6
53
0
3
6
90
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2.1
19
85
0
53
12
5
2
80
0.98
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50
2.2
51
77
7
120
45
4
8
42
1.54
6821680--6821730
23
2.2
23
85
0
75
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11
21
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1.90
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34.0
2
87
0
73
42
0
8
48
1.34
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47
2.0
45
87
4
134
40
9
8
41
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
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2.2
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90
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1
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1.37
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52
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174
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26
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18
32
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39
1.82
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2.5
24
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2
70
17
33
9
38
1.83
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51
2.8
51
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170
27
25
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40
1.81
6836985--6837140
52
3.0
51
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174
26
25
7
40
1.82
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2.5
24
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2
70
17
33
9
38
1.83
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3.0
52
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1
217
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26
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3.8
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100
0
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28
0
19
1.46
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2.1
25
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63
20
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1.76
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3.0
52
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7
185
26
23
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1.82
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25
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24
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11
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17
35
10
36
1.85
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2.8
52
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179
27
23
6
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1.79
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11
2.8
11
100
0
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29
0
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2.5
28
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129
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1.41
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24
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12
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1.67
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122
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12
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11
10
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124
1.8
125
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4
311
36
10
11
41
1.75
6845627--6845824
63
3.1
62
78
8
186
45
9
6
37
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6845458--6845903
212
2.1
211
81
3
513
46
10
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37
1.63
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17
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17
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0
51
25
0
2
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2.0
479
88
1
1452
38
12
12
37
1.80
6863034--6863115
22
3.6
22
77
17
80
58
13
4
23
1.54
6863034--6863108
11
6.5
11
72
11
60
58
13
5
22
1.55
6863331--6863371
13
3.2
13
86
10
57
82
0
2
14
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6863337--6863376
19
2.2
19
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87
0
2
10
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6
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6
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0
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23
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5
1
27
1.22
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100
0
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0
0
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0
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14
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14
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100
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0
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20
7
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35
1.82
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25
2.0
25
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0
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4
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54
3
0
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19
3.1
19
80
16
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66
1
0
31
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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9
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10
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1
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1.31
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21
2.5
21
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6
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40
4
2
54
1.31
6917218--6917268
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19
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3
1
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1.31
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20
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19
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2.2
31
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1
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15
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25
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28
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44
2.0
44
82
8
106
32
3
9
55
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6924570--6924698
20
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20
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18
105
35
3
10
50
1.54
6924585--6924698
55
2.1
55
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185
35
3
9
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1.52
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38
2.1
37
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2
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1.46
6931403--6931440
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0
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6932596--6932784
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2.2
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7
227
28
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18
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3.0
34
81
8
120
28
1
12
57
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402