Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  250  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24715776--24715860
38
2.2
36
78
15
91
44
1
1
52
1.16
24715798--24715932
19
7.1
19
67
22
52
49
0
2
47
1.19
24715790--24715845
19
2.9
19
76
12
60
44
0
0
55
0.99
24716324--24716353
14
2.1
14
100
0
60
46
0
0
53
1.00
24716347--24716384
12
3.2
12
81
3
51
44
0
5
50
1.24
24716372--24716418
13
3.5
13
80
13
60
31
0
4
63
1.13
24716586--24716615
12
2.4
12
94
5
51
56
0
0
43
0.99
24717168--24717236
23
3.1
21
70
27
54
44
1
1
52
1.19
24717189--24717235
18
2.7
18
80
6
53
44
0
0
55
0.99
24717396--24717455
25
2.5
22
78
19
59
50
3
1
45
1.28
24717412--24717453
14
2.7
15
85
10
50
50
4
2
42
1.36
24717595--24717636
17
2.6
16
81
7
57
52
0
0
47
1.00
24717738--24717787
21
2.4
21
83
12
59
46
4
0
50
1.20
24717840--24717899
16
3.7
15
80
14
59
38
3
1
56
1.26
24718033--24718072
15
2.6
16
82
17
50
45
0
5
50
1.23
24719631--24719663
17
2.0
17
88
5
50
39
12
0
48
1.40
24719330--24721275
181
10.7
182
70
13
839
42
10
7
39
1.69
24719337--24720231
179
5.0
176
75
10
670
42
9
7
39
1.67
24719355--24720247
360
2.5
356
78
8
841
42
10
7
39
1.68
24721339--24721371
17
1.9
18
88
11
52
63
3
0
33
1.10
24721163--24721396
129
1.8
128
83
4
310
47
7
7
37
1.59
24721288--24721959
181
3.7
177
77
9
551
43
9
7
38
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24722202--24722297
46
2.1
46
90
0
147
41
5
14
38
1.68
24722319--24724203
181
10.5
181
76
7
1485
41
10
7
40
1.67
24722319--24724203
361
5.2
353
76
8
1382
41
10
7
40
1.67
24723370--24723418
18
2.8
18
81
15
66
38
10
4
46
1.57
24722288--24724203
542
3.6
534
77
7
1685
41
10
7
40
1.67
24724210--24724818
179
3.4
173
77
9
519
41
7
9
42
1.64
24724210--24725474
178
7.2
176
70
14
582
39
7
9
42
1.67
24725071--24725502
181
2.4
181
83
2
503
38
8
10
42
1.70
24725892--24725957
20
3.5
20
77
6
59
50
7
4
37
1.52
24726502--24726553
19
2.7
19
71
14
52
46
1
1
50
1.23
24727662--24727707
20
2.1
21
88
11
67
41
0
0
58
0.98
24727860--24727917
28
2.0
29
87
9
84
50
3
1
44
1.29
24728076--24728123
19
2.4
20
86
6
62
45
6
0
47
1.27
24728094--24728132
19
2.1
19
85
0
51
46
10
0
43
1.37
24728305--24728334
15
2.0
15
100
0
60
53
0
0
46
1.00
24728596--24729168
182
3.2
178
80
5
622
43
8
8
39
1.65
24730031--24730081
22
2.3
22
80
10
59
45
1
3
49
1.32
24730181--24730229
22
2.3
21
82
3
62
48
2
0
48
1.12
24730471--24730594
12
10.2
12
68
17
51
50
0
1
46
1.16
24730507--24730592
12
6.8
12
71
11
55
54
1
1
43
1.15
24730479--24730592
37
3.1
37
82
13
112
53
0
0
44
1.12
24730505--24730561
27
2.1
27
83
6
71
52
1
1
43
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24730481--24730597
28
4.4
27
72
16
75
51
0
0
47
1.12
24730629--24730696
27
2.6
25
76
17
66
50
0
0
50
1.00
24730848--24730922
26
2.8
26
76
21
82
52
1
0
46
1.09
24731511--24731563
17
3.1
17
76
15
56
56
3
0
39
1.17
24731698--24731743
15
2.8
17
80
9
60
36
2
0
60
1.09
24731704--24731743
17
2.5
15
84
8
53
35
2
0
62
1.09
24731843--24732259
179
2.3
178
89
2
613
42
8
7
41
1.64
24732128--24732409
150
1.9
150
82
3
354
40
9
7
42
1.66
24732128--24732409
149
1.9
149
82
3
352
40
9
7
42
1.66
24732750--24732787
12
3.2
12
88
7
60
50
0
0
50
1.00
24732838--24732885
14
3.4
14
80
11
53
47
2
0
50
1.12
24733430--24733462
13
2.6
13
90
4
50
57
3
6
33
1.38
24733531--24733590
21
2.9
21
69
16
52
35
1
6
56
1.35
24735473--24735522
24
2.0
25
84
3
66
48
0
2
50
1.12
24735670--24735719
13
3.7
13
81
5
55
48
0
0
52
1.00
24736365--24736436
35
2.0
36
82
12
87
50
4
1
44
1.30
24736602--24736668
8
7.2
9
77
15
66
44
0
1
53
1.09
24736623--24736686
33
2.1
29
82
11
74
46
0
1
51
1.10
24736613--24736688
38
2.0
38
85
10
102
47
0
1
51
1.09
24737177--24737211
17
2.1
17
89
10
54
51
0
0
48
1.00
24737180--24737216
13
2.8
13
87
0
56
43
0
0
56
0.99
24738434--24738505
21
3.4
21
69
17
60
51
6
1
40
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24738548--24738585
20
1.9
20
88
0
58
52
0
0
47
1.00
24738746--24738804
17
3.4
17
75
11
57
42
0
6
50
1.28
24738889--24738977
34
2.6
31
76
16
79
46
3
0
50
1.18
24738897--24738944
13
3.4
13
80
13
51
47
2
0
50
1.12
24738890--24738991
48
2.1
50
80
12
113
45
3
0
50
1.20
24740944--24740978
13
2.8
12
87
8
52
42
0
8
48
1.33
24741988--24742046
22
2.7
22
78
5
66
50
0
0
49
1.00
24742063--24742087
13
1.9
13
100
0
50
56
0
4
40
1.18
24742257--24742812
177
3.1
175
79
5
535
42
9
8
39
1.68
24742878--24742913
17
2.0
19
89
10
58
50
2
0
47
1.15
24742967--24743055
13
6.9
13
70
22
55
48
0
1
50
1.08
24742984--24743048
18
3.4
18
81
10
76
49
0
0
50
1.00
24743506--24743569
21
3.2
20
79
20
71
50
1
0
48
1.10
24743537--24743570
13
2.6
13
90
0
50
52
0
0
47
1.00
24743510--24743578
21
3.1
23
75
21
67
50
1
0
47
1.09
24743537--24743591
15
3.9
14
79
9
51
49
1
0
49
1.11
24744024--24744365
181
1.9
181
84
3
465
39
9
10
40
1.71
24744024--24744434
181
2.3
180
81
2
457
39
9
10
40
1.72
24744209--24744658
224
2.0
224
80
3
503
38
8
10
42
1.69
24744433--24744877
180
2.5
177
78
6
430
38
8
9
44
1.66
24745474--24745538
16
4.2
15
75
14
53
60
3
3
33
1.28
24745893--24746117
123
1.8
123
86
3
328
39
8
10
41
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24746004--24747422
181
7.9
181
79
5
1338
39
7
10
42
1.68
24746004--24747422
361
3.9
358
78
5
1378
39
7
10
42
1.68
24746004--24747446
180
8.0
181
78
5
1316
39
7
10
42
1.68
24747448--24748090
181
3.5
181
79
3
659
42
9
10
37
1.71
24748043--24748095
19
3.0
18
75
10
56
49
5
9
35
1.59
24748112--24750185
181
11.6
179
75
7
1411
41
9
8
40
1.67
24748107--24750110
182
11.2
177
75
7
1392
41
9
8
40
1.67
24750207--24750268
12
5.3
11
72
12
52
41
1
1
54
1.19
24750195--24750276
24
3.5
23
71
18
71
43
2
1
52
1.22
24750401--24750438
19
2.0
19
100
0
76
57
0
0
42
0.98
24750905--24751481
177
3.2
179
78
7
523
40
7
8
42
1.64
24751354--24751614
143
1.8
141
83
3
344
35
9
12
42
1.75
24753220--24753278
24
2.4
24
78
18
68
54
5
0
40
1.23
24753349--24753380
16
1.9
17
93
6
57
40
6
0
53
1.26
24753623--24753656
16
2.2
15
89
5
50
47
5
0
47
1.26
24753836--24753874
19
2.1
19
85
9
53
48
2
2
46
1.29
24753890--24754021
20
6.4
22
67
18
86
46
2
2
49
1.27
24753963--24754043
13
5.8
14
75
15
78
53
1
0
45
1.08
24753965--24754056
30
3.0
30
81
10
82
53
1
1
44
1.15
24753987--24754043
23
2.7
20
75
22
53
56
0
0
43
0.99
24754376--24754405
14
2.1
14
93
0
51
53
0
0
46
1.00
24755879--24755938
21
3.1
21
79
15
67
36
3
0
60
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24755936--24756009
4
17.5
4
75
20
55
48
1
2
47
1.24
24755934--24756010
22
3.6
21
79
19
72
49
1
2
46
1.23
24755958--24756021
20
3.0
21
81
16
71
53
1
3
42
1.26
24756067--24756126
25
2.4
26
77
8
70
56
1
0
41
1.09
24756095--24756125
3
10.0
3
93
6
53
64
0
0
35
0.94
24756173--24756227
18
3.1
17
80
19
60
45
1
1
50
1.22
24756321--24756350
15
2.0
15
100
0
60
40
0
0
60
0.97
24756391--24756417
14
1.9
14
100
0
54
66
3
0
29
1.09
24756905--24756943
19
2.1
18
90
4
60
56
0
0
43
0.99
24757262--24757330
25
2.8
23
82
8
75
50
0
2
46
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402