Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  47  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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126
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2.5
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104
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32
14
15
37
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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9175205--9175251
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20
15
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1.89
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12.7
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0
0
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2.8
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85
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1.9
170
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390
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14
22
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1.9
19
88
0
56
48
13
16
21
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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4
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1.37
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72
18
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3
4
37
1.36
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21
2.3
21
89
7
71
64
2
0
33
1.05
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4.5
31
72
20
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54
3
4
37
1.37
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2.0
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240
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11
22
21
1.83
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7.5
120
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1.85
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18
18
42
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9229607--9229671
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20
17
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109
1.8
110
85
3
287
21
19
17
43
1.89
9230055--9230327
145
1.9
145
83
1
359
23
17
15
42
1.88
9230921--9230977
17
3.4
17
73
9
53
56
1
3
38
1.27
9232615--9232679
20
3.2
20
74
10
69
49
33
0
16
1.47
9232721--9232753
14
2.3
15
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5
50
57
30
0
12
1.35
9232720--9232761
15
2.8
15
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10
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59
26
0
14
1.35
9232730--9232939
107
2.0
107
93
0
357
40
23
9
27
1.84
9232843--9232883
16
2.6
16
88
3
57
60
24
2
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1.43
9233771--9233809
20
1.9
21
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38
12
2
46
1.56
9237800--9237955
3
55.0
3
68
22
70
57
3
3
35
1.33
9237840--9237988
11
13.7
11
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24
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53
5
5
35
1.47
9237836--9237991
40
3.9
40
71
23
116
53
5
5
35
1.45
9237799--9237918
49
2.5
47
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15
120
57
2
3
36
1.29
9237842--9237988
69
2.0
77
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12
195
53
5
5
35
1.47
9237848--9237957
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3.1
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1.40
9237888--9237991
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10
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3
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3
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0
0
29
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23
2.5
24
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15
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70
1
6
20
1.19
9240550--9240587
17
2.1
19
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73
0
7
18
1.06
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3
15.0
3
90
4
65
63
0
4
32
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9241470--9241510
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0
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34
0
0
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66
2.1
65
84
4
173
48
9
21
20
1.78
9253422--9253468
17
2.6
18
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53
2
0
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1.12
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15
2.2
16
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23
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0
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0
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76
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18
2.1
18
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0
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27
2.1
27
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43
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18
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18
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0
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23
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32
9
16
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1.80
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193
1.8
192
82
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460
41
13
12
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1.82
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22
2.3
22
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2.4
71
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27
1.78
9280539--9280578
20
2.0
20
85
5
53
52
10
10
27
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9285806--9285837
9
3.8
9
84
16
50
12
0
0
87
0.54
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17
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12
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20
0
0
79
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2.1
62
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2
169
36
13
12
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9297369--9297524
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2.5
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19
0
0
0.71
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0
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14
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3
54
77
2
0
20
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402