Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  2  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112904--113205
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2
432
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13
17
16
1.75
113115--113375
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3.3
79
77
3
279
54
14
16
14
1.71
113237--113522
80
3.6
80
73
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18
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2.8
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155
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11
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113678--113831
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2.3
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82
3
184
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11
24
35
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13
171
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23
32
1.92
113756--113988
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2.5
94
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274
30
14
24
30
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113809--114018
94
2.2
92
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235
33
15
22
28
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22
3.7
22
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85
27
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90
9
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10
0
0
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0.48
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2.2
15
89
10
50
15
0
0
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22
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0
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2.0
28
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0
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25
8
32
1.87
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3.2
180
80
8
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8
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10
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126790--127997
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180
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895
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41
1.70
126890--127997
361
3.1
360
77
8
898
40
8
9
41
1.69
126942--127937
541
1.8
542
79
5
1165
40
9
9
40
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127999--129404
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3.9
357
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8
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40
7
9
42
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128133--129404
540
2.4
538
80
6
1351
40
8
9
41
1.67
129149--129752
313
1.9
313
80
6
701
42
7
8
40
1.65
129460--134890
719
7.7
708
72
13
2669
40
8
9
41
1.68
130801--130854
18
3.1
18
70
21
51
37
5
9
48
1.59
129460--132950
181
19.7
181
71
12
1732
39
8
10
42
1.68
132948--132994
18
2.6
18
80
9
60
34
8
2
55
1.42
133184--134910
181
9.6
180
77
7
1445
40
8
9
41
1.68
129460--134905
538
10.3
539
71
12
2002
40
8
9
41
1.68
134663--134714
18
2.9
19
69
16
56
48
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7
36
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134852--134884
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1.9
17
88
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50
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6
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1.9
178
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414
39
7
11
41
1.70
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1.9
296
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1.67
135929--137700
180
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181
74
8
435
40
8
9
42
1.67
135490--148514
181
71.7
181
70
12
4901
39
8
10
41
1.69
135490--141141
539
10.4
536
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9
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9
42
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137887--137937
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2.2
23
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0
102
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3
3
50
1.39
135490--151332
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22.0
711
69
14
2658
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9
41
1.69
140220--140593
202
1.8
203
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2
565
39
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9
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1.71
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296
1.8
298
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5
718
41
7
10
40
1.68
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25
2.3
25
96
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50
12
10
27
1.72
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1.9
145
81
2
337
40
10
8
40
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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41
1.70
142605--151332
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10
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9
41
1.70
142610--149965
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8.2
889
71
12
2515
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8
10
41
1.70
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179
11.7
179
73
7
1142
39
8
10
41
1.70
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180
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177
76
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446
43
9
7
40
1.64
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2.6
180
76
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430
39
8
7
44
1.63
149535--149989
179
2.5
179
78
5
447
40
9
9
40
1.70
150249--150587
176
1.9
179
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440
42
7
7
41
1.63
148654--151332
692
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686
75
8
1714
40
8
9
41
1.68
150953--151325
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2.1
176
83
4
439
41
7
10
39
1.69
151336--156275
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13.9
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10
2572
40
9
8
41
1.67
151336--156275
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9
3317
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9
8
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2.0
19
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10
44
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18.5
181
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8
41
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157
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157826--157950
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3.0
42
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11
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66
2
5
25
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
157843--157960
21
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20
75
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1
5
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13
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1.28
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1
5
30
1.26
157932--158001
22
3.3
20
76
15
70
60
1
4
34
1.25
157932--158012
42
2.0
42
87
4
121
58
3
3
34
1.34
158028--158097
11
6.5
11
72
20
58
67
2
1
28
1.14
158081--158149
33
2.1
34
83
8
88
73
2
2
20
1.09
158071--158171
7
15.2
6
75
18
60
74
2
2
19
1.08
158077--158164
26
3.3
27
75
9
74
73
3
3
19
1.11
158350--158642
42
6.9
42
80
8
219
37
20
17
25
1.93
158350--158646
84
3.5
81
79
10
262
37
20
17
25
1.94
158478--158646
41
4.1
41
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8
191
35
20
17
27
1.94
159657--159681
13
1.9
13
100
0
50
8
12
0
80
0.92
162865--162934
11
6.5
11
72
20
58
67
2
1
28
1.14
162918--162984
32
2.1
33
83
8
84
73
2
2
20
1.10
163230--163481
42
6.0
42
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15
159
36
19
17
26
1.94
163277--163374
43
2.4
42
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11
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32
20
21
25
1.97
164484--164510
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1.9
14
100
0
54
7
11
0
81
0.87
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58
3.8
60
83
6
273
35
12
8
42
1.75
174948--175172
118
1.9
118
87
5
330
35
12
8
42
1.75
175181--175230
16
3.2
16
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13
68
82
0
4
14
0.82
175185--175230
5
8.8
5
86
13
58
82
0
2
15
0.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
175719--175787
31
2.2
32
84
7
88
49
23
10
17
1.77
176144--176245
42
2.4
40
79
9
114
62
2
6
27
1.35
176138--176255
21
5.6
20
76
9
83
64
2
5
27
1.30
176208--176284
14
5.4
14
72
17
68
61
2
2
33
1.24
176208--176284
36
2.1
36
83
9
95
61
2
2
33
1.24
176199--176497
8
37.9
8
72
19
78
65
2
3
28
1.21
176227--176298
22
3.3
21
72
14
65
58
2
4
34
1.32
176334--176413
4
19.8
4
73
16
67
67
2
2
27
1.16
176323--176412
31
3.0
30
72
16
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2
2
28
1.15
176428--176531
16
6.9
16
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11
141
76
0
0
21
0.89
176428--176531
24
4.6
24
83
13
141
76
0
0
21
0.89
176688--177203
181
2.9
179
81
4
606
42
10
8
38
1.69
177161--177300
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2.1
67
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4
212
35
13
7
44
1.71
177249--181824
181
25.6
179
75
7
3090
42
9
8
39
1.68
177249--181822
717
6.4
720
76
7
3495
42
9
8
39
1.68
179544--179849
165
1.8
167
82
8
390
43
9
5
40
1.62
179767--181794
177
11.3
176
73
9
939
42
10
8
39
1.68
177249--181787
540
8.5
535
75
8
2843
42
9
8
39
1.68
182340--182570
61
3.8
61
90
4
360
39
12
7
39
1.73
182340--182570
119
1.9
121
90
4
367
39
12
7
39
1.73
182587--182740
6
25.5
6
72
13
61
70
3
3
22
1.18
182587--182644
18
3.4
17
83
6
73
75
1
5
17
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
182665--182702
16
2.4
17
86
8
53
60
2
2
34
1.24
183516--183798
26
11.1
25
70
22
87
67
2
2
27
1.15
183563--183720
39
3.9
42
77
16
158
64
1
2
31
1.17
183505--183756
68
3.7
69
75
13
188
65
2
3
28
1.20
183554--183799
4
61.5
4
70
16
138
68
2
2
27
1.13
183533--183747
39
5.5
38
73
17
140
66
2
2
29
1.17
183510--183746
34
6.7
35
75
15
170
65
2
3
29
1.20
183581--183797
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5.7
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16
134
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2
1
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1.13
183718--183801
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13
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75
3
1
20
1.03
183694--183800
7
15.0
7
75
11
76
74
3
0
20
1.02

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402