Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  41  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8131028--8131070
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131
25
10
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1.80
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2
0
0.58
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142
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52
2.2
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156
48
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15
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5.4
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212
26
12
17
42
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
1
1
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6
11.3
6
73
14
61
17
1
1
79
0.88
8141948--8141976
7
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7
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13
0
0
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3
61
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0
9
0.71
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2
13
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23
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2.0
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25
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14
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4.1
40
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155
27
13
16
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50
2.0
50
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4
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13
12
21
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1.9
30
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0
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0
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1.00
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2.5
19
82
10
60
10
0
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65
1.23
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20
3.4
19
79
6
78
25
1
16
56
1.49
8160368--8160412
19
2.6
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83
16
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19
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16
2
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1.05
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14
8.0
14
71
17
64
16
2
4
76
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
13
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2
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53
0
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2.0
26
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70
30
23
28
17
1.97
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23
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18
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33
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7
29
1.84
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0
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0
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0
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22
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0
2
22
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9
54
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0
3
31
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50
2
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1.36
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15
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2.1
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13
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188
34
16
11
37
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8206248--8206282
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57
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1.60
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18
7
18
1.65
8212769--8212799
16
1.9
16
93
0
53
67
0
22
9
1.19
8218074--8218112
16
2.5
16
87
4
53
5
17
2
74
1.12
8218658--8218737
21
3.8
21
83
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90
52
7
0
40
1.30
8218658--8218709
7
7.4
7
75
16
54
55
5
0
38
1.24
8218577--8218729
80
1.9
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81
9
188
48
7
1
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1.42
8218908--8218942
18
1.9
18
94
0
61
65
2
2
28
1.21
8219064--8219164
37
2.7
36
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34
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27
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26
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10
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5
0
25
1.10
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21
2.0
22
90
4
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14
0
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1.29
8220164--8220212
21
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19
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15
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12
0
18
1.19
8221535--8221611
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28
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1.37
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25
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25
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0
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1.49
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18
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1.30
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19
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30
0
5
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1.17
8222170--8222220
9
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9
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23
1
1
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1.05
8222170--8222220
19
2.6
19
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11
59
23
1
1
72
1.05
8222208--8222272
26
2.5
26
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26
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1
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1.29
8222234--8222274
17
2.4
18
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21
9
0
68
1.18
8222770--8222812
18
2.5
17
84
3
50
76
0
20
2
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8222757--8222812
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3.2
17
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5
58
75
1
17
5
1.09
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14
3.1
14
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6
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54
2
0
43
1.12
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18
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18
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0
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0
0
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19
2.4
19
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46
6
2
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0
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2.0
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5
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22
3.0
22
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10
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1.9
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24
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0
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0
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2.1
16
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0
0
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0
0
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11
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0
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
2
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0.97
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24
0
4
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66
56
0
0
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2.0
73
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0
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2.1
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159
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42
4.4
42
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0
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0
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0
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0
0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402